RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 MT1EP04732 61 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.6□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 A8MU10 97 aa4.58□□□□□ -1.68
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.56□□□□□ -1.68
PRAME-204ENST00000403441 PRR15LQ9BU68 103 aa4.56□□□□□ -1.68
PRAME-204ENST00000403441 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.52□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 SVIPQ8NHG7 77 aa4.51□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 PP632Q6XCG6 107 aa4.5□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 MT1GP13640 62 aa4.49□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 MT4P47944 62 aa4.48□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-204ENST00000403441 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.45□□□□□ -1.7
PRAME-204ENST00000403441 UQCR11O14957 56 aa4.45□□□□□ -1.7
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.45□□□□□ -1.7
PRAME-204ENST00000403441 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PRAME-204ENST00000403441 MT1MQ8N339 61 aa4.4□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 TNP1P09430 55 aa4.39□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 Q1T7F1 81 aa4.37□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 LCE3AQ5TA76 89 aa4.37□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 MT1LQ93083 61 aa4.36□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.35□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 V9GYY9 64 aa4.35□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.34□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.34□□□□□ -1.71
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.29□□□□□ -1.72
PRAME-204ENST00000403441 PSPHP1O15172 72 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.23□□□□□ -1.73
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.23□□□□□ -1.73
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP12-3P60328 96 aa4.2□□□□□ -1.74
PRAME-204ENST00000403441 K7ERS5 55 aa4.19□□□□□ -1.74
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.19□□□□□ -1.74
PRAME-204ENST00000403441 A6NED7 52 aa4.13□□□□□ -1.75
PRAME-204ENST00000403441 PRO0628Q9UI54 55 aa4.13□□□□□ -1.75
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.12□□□□□ -1.75
PRAME-204ENST00000403441 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.09□□□□□ -1.75
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP12-4P60329 112 aa4.06□□□□□ -1.76
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PRAME-204ENST00000403441 BRK1Q8WUW1 75 aa4.04□□□□□ -1.76
PRAME-204ENST00000403441 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PRAME-204ENST00000403441 ROMO1P60602 79 aa3.97□□□□□ -1.77
PRAME-204ENST00000403441 A0A0A0MQY5 61 aa3.96□□□□□ -1.78
PRAME-204ENST00000403441 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.89□□□□□ -1.79
PRAME-204ENST00000403441 PMAIP1Q13794 54 aa3.87□□□□□ -1.79
PRAME-204ENST00000403441 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PRAME-204ENST00000403441 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PRAME-204ENST00000403441 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.78□□□□□ -1.8
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.76□□□□□ -1.81
PRAME-204ENST00000403441 MUC5ACP98088 5654 aa3.76□□□□□ -1.81
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.71□□□□□ -1.82
PRAME-204ENST00000403441 MT1AP04731 61 aa3.71□□□□□ -1.82
PRAME-204ENST00000403441 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-8O75690 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.69□□□□□ -1.82
PRAME-204ENST00000403441 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.64□□□□□ -1.83
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.59□□□□□ -1.83
PRAME-204ENST00000403441 MT3P25713 68 aa3.48□□□□□ -1.85
PRAME-204ENST00000403441 PRAC1Q96KF2 57 aa3.47□□□□□ -1.85
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.41□□□□□ -1.86
PRAME-204ENST00000403441 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
PRAME-204ENST00000403441 LCE1EQ5T753 118 aa3.22□□□□□ -1.89
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.21□□□□□ -1.9
PRAME-204ENST00000403441 NDUFAF8A1L188 74 aa3.14□□□□□ -1.91
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PRAME-204ENST00000403441 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.04□□□□□ -1.92
PRAME-204ENST00000403441 LCE1CQ5T751 118 aa2.96□□□□□ -1.94
PRAME-204ENST00000403441 LUZP6Q538Z0 58 aa2.94□□□□□ -1.94
PRAME-204ENST00000403441 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.81□□□□□ -1.96
PRAME-204ENST00000403441 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.78□□□□□ -1.96
PRAME-204ENST00000403441 PHGR1C9JFL3 82 aa2.57□□□□□ -2
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.56□□□□□ -2
PRAME-204ENST00000403441 INE1O15225 51 aa2.55□□□□□ -2
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.43□□□□□ -2.02
PRAME-204ENST00000403441 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.24□□□□□ -2.05
PRAME-204ENST00000403441 PRM1P04553 51 aa2.02□□□□□ -2.09
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.96□□□□□ -2.1
PRAME-204ENST00000403441 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
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