RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.11□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0D9SG42 100 aa3.1□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.09□□□□□ -1.91
SGMS1-201ENST00000361543 UQCR11O14957 56 aa3.08□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-12P60413 245 aa3.06□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.06□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 Q1T7F1 81 aa3.05□□□□□ -1.92
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP12-1P59990 96 aa3.02□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 K7ERS5 55 aa3□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR2DP22532 72 aa3□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 A8MU10 97 aa2.99□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.99□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 PSPHP1O15172 72 aa2.98□□□□□ -1.93
SGMS1-201ENST00000361543 A6NED7 52 aa2.94□□□□□ -1.94
SGMS1-201ENST00000361543 TNP1P09430 55 aa2.92□□□□□ -1.94
SGMS1-201ENST00000361543 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.87□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 MT1EP04732 61 aa2.86□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.86□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.86□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.84□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.84□□□□□ -1.95
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.83□□□□□ -1.96
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.81□□□□□ -1.96
SGMS1-201ENST00000361543 LCE1FQ5T754 118 aa2.81□□□□□ -1.96
SGMS1-201ENST00000361543 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.79□□□□□ -1.96
SGMS1-201ENST00000361543 LCE3AQ5TA76 89 aa2.76□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 MT1GP13640 62 aa2.75□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 ROMO1P60602 79 aa2.75□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 PP632Q6XCG6 107 aa2.75□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 MT1LQ93083 61 aa2.73□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 MT1MQ8N339 61 aa2.72□□□□□ -1.97
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP12-3P60328 96 aa2.7□□□□□ -1.98
SGMS1-201ENST00000361543 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.69□□□□□ -1.98
SGMS1-201ENST00000361543 BRK1Q8WUW1 75 aa2.68□□□□□ -1.98
SGMS1-201ENST00000361543 MT4P47944 62 aa2.67□□□□□ -1.98
SGMS1-201ENST00000361543 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.67□□□□□ -1.98
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.65□□□□□ -1.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.65□□□□□ -1.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.65□□□□□ -1.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.63□□□□□ -1.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.59□□□□□ -1.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.58□□□□□ -2
SGMS1-201ENST00000361543 PRO0628Q9UI54 55 aa2.57□□□□□ -2
SGMS1-201ENST00000361543 PMAIP1Q13794 54 aa2.55□□□□□ -2
SGMS1-201ENST00000361543 LUZP6Q538Z0 58 aa2.55□□□□□ -2
SGMS1-201ENST00000361543 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.52□□□□□ -2.01
SGMS1-201ENST00000361543 LCE1EQ5T753 118 aa2.51□□□□□ -2.01
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.45□□□□□ -2.02
SGMS1-201ENST00000361543 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SGMS1-201ENST00000361543 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.44□□□□□ -2.02
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP12-4P60329 112 aa2.43□□□□□ -2.02
SGMS1-201ENST00000361543 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
SGMS1-201ENST00000361543 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.35□□□□□ -2.03
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.33□□□□□ -2.04
SGMS1-201ENST00000361543 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SGMS1-201ENST00000361543 MT1AP04731 61 aa2.32□□□□□ -2.04
SGMS1-201ENST00000361543 MUC5ACP98088 5654 aa2.32□□□□□ -2.04
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.31□□□□□ -2.04
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.27□□□□□ -2.05
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP5-8O75690 187 aa2.21□□□□□ -2.06
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.21□□□□□ -2.06
SGMS1-201ENST00000361543 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.21□□□□□ -2.06
SGMS1-201ENST00000361543 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.11□□□□□ -2.07
SGMS1-201ENST00000361543 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.84□□□□□ -2.11
SGMS1-201ENST00000361543 LCE1CQ5T751 118 aa1.81□□□□□ -2.12
SGMS1-201ENST00000361543 PHGR1C9JFL3 82 aa1.56□□□□□ -2.16
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.52□□□□□ -2.17
SGMS1-201ENST00000361543 INE1O15225 51 aa1.51□□□□□ -2.17
SGMS1-201ENST00000361543 PRM1P04553 51 aa1.38□□□□□ -2.19
SGMS1-201ENST00000361543 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.37□□□□□ -2.19
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.19□□□□□ -2.22
SGMS1-201ENST00000361543 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms