RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 MT1XP80297 61 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 CSMD2Q7Z408 3487 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 MUC3AQ02505 3323 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa1.65□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 MT1AP04731 61 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.61□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 MT1MQ8N339 61 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRD-201ENST00000355233 MUC17Q685J3 4493 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRD-201ENST00000355233 LCE1AQ5T7P2 110 aa1.55□□□□□ -2.16
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.54□□□□□ -2.16
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa1.51□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa1.51□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 NEBP20929 6669 aa1.51□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa1.48□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.47□□□□□ -2.17
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa1.46□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.46□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 LCE1DQ5T752 114 aa1.45□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa1.45□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 LOC100996750A0A140TA64 210 aa1.45□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa1.45□□□□□ -2.18
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PTPRD-201ENST00000355233 MT4P47944 62 aa1.41□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.41□□□□□ -2.18
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.41□□□□□ -2.18
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PTPRD-201ENST00000355233 LCE5AQ5TCM9 118 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.39□□□□□ -2.19
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PTPRD-201ENST00000355233 MUC5ACP98088 5654 aa1.33□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-9P26371 169 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRD-201ENST00000355233 LCE1FQ5T754 118 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.27□□□□□ -2.21
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PTPRD-201ENST00000355233 LCE1EQ5T753 118 aa1.18□□□□□ -2.22
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PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRD-201ENST00000355233 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
PTPRD-201ENST00000355233 LCE1CQ5T751 118 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.08□□□□□ -2.24
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.07□□□□□ -2.24
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.25
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-8O75690 187 aa0.92□□□□□ -2.26
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-2Q701N4 177 aa0.89□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.86□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa0.86□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.86□□□□□ -2.27
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.78□□□□□ -2.28
PTPRD-201ENST00000355233 PHGR1C9JFL3 82 aa0.77□□□□□ -2.29
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRD-201ENST00000355233 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.6□□□□□ -2.31
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