RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 K7ERS5 55 aa6.93□□□□□ -1.3
PUS1-201ENST00000322060 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.93□□□□□ -1.3
PUS1-201ENST00000322060 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.92□□□□□ -1.3
PUS1-201ENST00000322060 PRO0628Q9UI54 55 aa6.86□□□□□ -1.31
PUS1-201ENST00000322060 LCE1DQ5T752 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PUS1-201ENST00000322060 MT1GP13640 62 aa6.8□□□□□ -1.32
PUS1-201ENST00000322060 LCE4AQ5TA78 99 aa6.76□□□□□ -1.33
PUS1-201ENST00000322060 PP632Q6XCG6 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.7□□□□□ -1.34
PUS1-201ENST00000322060 PMAIP1Q13794 54 aa6.69□□□□□ -1.34
PUS1-201ENST00000322060 MT4P47944 62 aa6.67□□□□□ -1.34
PUS1-201ENST00000322060 MT1MQ8N339 61 aa6.64□□□□□ -1.35
PUS1-201ENST00000322060 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.62□□□□□ -1.35
PUS1-201ENST00000322060 ROMO1P60602 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.59□□□□□ -1.35
PUS1-201ENST00000322060 MT1LQ93083 61 aa6.58□□□□□ -1.36
PUS1-201ENST00000322060 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.57□□□□□ -1.36
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.54□□□□□ -1.36
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.47□□□□□ -1.37
PUS1-201ENST00000322060 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.46□□□□□ -1.38
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.45□□□□□ -1.38
PUS1-201ENST00000322060 TNP1P09430 55 aa6.43□□□□□ -1.38
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.42□□□□□ -1.38
PUS1-201ENST00000322060 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.37□□□□□ -1.39
PUS1-201ENST00000322060 LCE3AQ5TA76 89 aa6.36□□□□□ -1.39
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.36□□□□□ -1.39
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.31□□□□□ -1.4
PUS1-201ENST00000322060 PRAC1Q96KF2 57 aa6.24□□□□□ -1.41
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.22□□□□□ -1.41
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.21□□□□□ -1.42
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.2□□□□□ -1.42
PUS1-201ENST00000322060 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.17□□□□□ -1.42
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP12-3P60328 96 aa6.15□□□□□ -1.42
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP12-4P60329 112 aa6.08□□□□□ -1.44
PUS1-201ENST00000322060 SVIPQ8NHG7 77 aa6□□□□□ -1.45
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.9□□□□□ -1.46
PUS1-201ENST00000322060 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.89□□□□□ -1.47
PUS1-201ENST00000322060 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.77□□□□□ -1.49
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.77□□□□□ -1.49
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.71□□□□□ -1.5
PUS1-201ENST00000322060 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.63□□□□□ -1.51
PUS1-201ENST00000322060 MT1AP04731 61 aa5.61□□□□□ -1.51
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-8O75690 187 aa5.58□□□□□ -1.52
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.57□□□□□ -1.52
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.47□□□□□ -1.53
PUS1-201ENST00000322060 MUC5ACP98088 5654 aa5.42□□□□□ -1.54
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.4□□□□□ -1.54
PUS1-201ENST00000322060 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PUS1-201ENST00000322060 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.35□□□□□ -1.55
PUS1-201ENST00000322060 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.33□□□□□ -1.56
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.31□□□□□ -1.56
PUS1-201ENST00000322060 LUZP6Q538Z0 58 aa5.17□□□□□ -1.58
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.17□□□□□ -1.58
PUS1-201ENST00000322060 MT3P25713 68 aa5.16□□□□□ -1.58
PUS1-201ENST00000322060 NDUFAF8A1L188 74 aa4.9□□□□□ -1.63
PUS1-201ENST00000322060 LCE1EQ5T753 118 aa4.87□□□□□ -1.63
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.58□□□□□ -1.68
PUS1-201ENST00000322060 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.52□□□□□ -1.69
PUS1-201ENST00000322060 LCE1CQ5T751 118 aa4.5□□□□□ -1.69
PUS1-201ENST00000322060 A0A0A0MQY5 61 aa4.32□□□□□ -1.72
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.23□□□□□ -1.73
PUS1-201ENST00000322060 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.13□□□□□ -1.75
PUS1-201ENST00000322060 LCE1FQ5T754 118 aa4.11□□□□□ -1.75
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.1□□□□□ -1.75
PUS1-201ENST00000322060 INE1O15225 51 aa4.09□□□□□ -1.75
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PUS1-201ENST00000322060 H3BS24 57 aa4.03□□□□□ -1.76
PUS1-201ENST00000322060 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.01□□□□□ -1.77
PUS1-201ENST00000322060 PHGR1C9JFL3 82 aa3.8□□□□□ -1.8
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.7□□□□□ -1.82
PUS1-201ENST00000322060 PRM1P04553 51 aa3.41□□□□□ -1.86
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.37□□□□□ -1.87
PUS1-201ENST00000322060 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.27□□□□□ -1.89
PUS1-201ENST00000322060 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.92□□□□□ -1.94
PUS1-201ENST00000322060 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 2628.2 ms