RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 MT1MQ8N339 61 aa4.81□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 MT3P25713 68 aa4.8□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 LPAP08519 4548 aa4.8□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.78□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CTIF-201ENST00000256413 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.77□□□□□ -1.65
CTIF-201ENST00000256413 PKHD1P08F94 4074 aa4.74□□□□□ -1.65
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.72□□□□□ -1.65
CTIF-201ENST00000256413 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-201ENST00000256413 TNXBP22105 4242 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.6□□□□□ -1.67
CTIF-201ENST00000256413 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.59□□□□□ -1.67
CTIF-201ENST00000256413 LCE1DQ5T752 114 aa4.58□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.57□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 LCE4AQ5TA78 99 aa4.57□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.56□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 MT1AP04731 61 aa4.55□□□□□ -1.68
CTIF-201ENST00000256413 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-201ENST00000256413 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.45□□□□□ -1.7
CTIF-201ENST00000256413 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.39□□□□□ -1.71
CTIF-201ENST00000256413 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.36□□□□□ -1.71
CTIF-201ENST00000256413 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.28□□□□□ -1.72
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.28□□□□□ -1.72
CTIF-201ENST00000256413 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.26□□□□□ -1.73
CTIF-201ENST00000256413 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.25□□□□□ -1.73
CTIF-201ENST00000256413 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.21□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 LCE1CQ5T751 118 aa4.2□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 LCE1EQ5T753 118 aa4.2□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 LCE1FQ5T754 118 aa4.2□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.17□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 RNF213Q63HN8 5207 aa4.17□□□□□ -1.74
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.15□□□□□ -1.75
CTIF-201ENST00000256413 MUC2Q02817 5179 aa3.99□□□□□ -1.77
CTIF-201ENST00000256413 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.74□□□□□ -1.81
CTIF-201ENST00000256413 USH2AO75445 5202 aa3.73□□□□□ -1.81
CTIF-201ENST00000256413 NEBP20929 6669 aa3.7□□□□□ -1.82
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-9P26371 169 aa3.64□□□□□ -1.83
CTIF-201ENST00000256413 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CTIF-201ENST00000256413 KMT2DO14686 5537 aa3.55□□□□□ -1.84
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CTIF-201ENST00000256413 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.49□□□□□ -1.85
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.45□□□□□ -1.86
CTIF-201ENST00000256413 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CTIF-201ENST00000256413 SSPOA2VEC9 5147 aa3.42□□□□□ -1.86
CTIF-201ENST00000256413 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.4□□□□□ -1.86
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.4□□□□□ -1.87
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.33□□□□□ -1.88
CTIF-201ENST00000256413 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.2□□□□□ -1.9
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.16□□□□□ -1.9
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.08□□□□□ -1.92
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.08□□□□□ -1.92
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.01□□□□□ -1.93
CTIF-201ENST00000256413 MDN1Q9NU22 5596 aa2.93□□□□□ -1.94
CTIF-201ENST00000256413 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.83□□□□□ -1.96
CTIF-201ENST00000256413 MUC5ACP98088 5654 aa2.76□□□□□ -1.97
CTIF-201ENST00000256413 PHGR1C9JFL3 82 aa2.76□□□□□ -1.97
CTIF-201ENST00000256413 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.74□□□□□ -1.97
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.7□□□□□ -1.98
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-8O75690 187 aa2.63□□□□□ -1.99
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.52□□□□□ -2.01
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.33□□□□□ -2.04
CTIF-201ENST00000256413 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.28□□□□□ -2.04
CTIF-201ENST00000256413 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.27□□□□□ -2.05
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.2□□□□□ -2.06
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.16□□□□□ -2.06
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
CTIF-201ENST00000256413 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.4□□□□□ -2.19
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