RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Shisal1Q0VBP7 198 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Srsf2Q62093 221 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1437Q7TQR7 312 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 AplnrQ9WV08 377 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Psmb11Q8BG41 302 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spink2Q8BMY7 86 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa14.72□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa14.71□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa14.71□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm9767G3X930 207 aa14.71□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mmp23O88676 391 aa14.71□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Crip3Q6Q6R3 243 aa14.71□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap32Q811P8 2089 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Runx1Q03347 451 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Megf10Q6DIB5 1147 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam19a2Q7TPG7 131 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 IqcjQ8BPW0 110 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn1r202Q8R259 302 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zmat5Q9CQR5 170 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Borcs7Q9CRC6 105 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q9D7E4 109 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube2l6Q9QZU9 153 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnfrsf9P20334 256 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Npc2Q9Z0J0 149 aa14.7□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fhl2O70433 279 aa14.69□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr365Q8VFT2 312 aa14.69□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Odf3Q920N1 254 aa14.69□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trbv17A0A140T8P8 114 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fndc10A2A9Q0 223 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rab4aP56371 218 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vsig8Q6P3A4 417 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Avpi1Q9D7H4 142 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wfdc2Q9DAU7 174 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv2-3A0A075B696 115 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cd69P37217 199 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 SnrpcQ62241 159 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 RnasekQ8K3C0 98 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1431Q8VF59 312 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hcfc2Q9D968 241 aa14.68□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 P01793 123 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Psmb8P28063 276 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm94Q3V2D2 93 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr311Q5NC59 308 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnfsf18Q7TS55 173 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 EpcamQ99JW5 315 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cml3Q9JIY8 226 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav9-2A0A075B647 113 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf664Q4VA44 261 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Leprotl1Q9CQ74 131 aa14.66□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3233E9Q2H5 230 aa14.65□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr312Q7TRZ9 308 aa14.65□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr975Q8VG91 310 aa14.65□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa14.65□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arl11Q6P3A9 176 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Obox1Q9D350 204 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 RhohQ9D3G9 191 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 LalbaP29752 143 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem241Q3UME2 297 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr317Q5NCD6 327 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam241bQ9D882 120 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plpp2Q9DAX2 276 aa14.64□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa14.63□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 LhbO09108 141 aa14.63□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 SeboxP70368 190 aa14.63□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nit2Q9JHW2 276 aa14.63□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 CnfnQ6PCW6 111 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tcf21O35437 179 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 7420426K07RikQ3UX66 186 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 NpbQ8K4P1 119 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam103a1Q9CQY2 119 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3443F7CCV5 94 aa14.61□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 CdsnQ7TPC1 561 aa14.61□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam216aQ9DB54 251 aa14.61□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa14.6□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf152Q8BG47 203 aa14.6□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem208Q9CR96 173 aa14.6□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dusp14Q9JLY7 198 aa14.6□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 1810032O08RikE9PZV8 113 aa14.59□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Klk15Q8CGR4 254 aa14.59□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mrpl20Q9CQL4 149 aa14.59□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dmbt1Q60997 2085 aa14.59□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa14.58□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm2564F6Z9S8 108 aa14.58□□□□□ -0.07
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10130F6ZHM5 101 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms