Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P01793 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01793 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P01793 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P01793 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01793 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
P01793 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01793 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01793 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01793 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01793 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01793 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01793 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01793 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01793 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01793 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01793 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01793 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01793 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01793 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01793 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01793 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01793 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01793 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01793 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01793 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01793 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01793 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01793 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01793 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01793 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01793 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01793 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01793 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01793 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
P01793 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01793 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P01793 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01793 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01793 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01793 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01793 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
P01793 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01793 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01793 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01793 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01793 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01793 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01793 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01793 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01793 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01793 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01793 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01793 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01793 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01793 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01793 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01793 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01793 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01793 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01793 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01793 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01793 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
P01793 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01793 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01793 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
P01793 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
P01793 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P01793 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
P01793 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P01793 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
P01793 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
P01793 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
P01793 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
P01793 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P01793 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P01793 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01793 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01793 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P01793 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01793 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01793 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01793 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01793 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01793 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P01793 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01793 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01793 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01793 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01793 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01793 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P01793 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01793 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01793 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01793 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01793 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01793 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01793 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01793 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01793 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms