Protein–RNA interactions for Protein: P29752

Lalba, Alpha-lactalbumin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LalbaP29752 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LalbaP29752 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LalbaP29752 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LalbaP29752 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LalbaP29752 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LalbaP29752 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LalbaP29752 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LalbaP29752 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LalbaP29752 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LalbaP29752 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LalbaP29752 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LalbaP29752 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LalbaP29752 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LalbaP29752 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LalbaP29752 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LalbaP29752 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LalbaP29752 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LalbaP29752 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LalbaP29752 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LalbaP29752 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LalbaP29752 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LalbaP29752 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LalbaP29752 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LalbaP29752 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LalbaP29752 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LalbaP29752 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LalbaP29752 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LalbaP29752 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LalbaP29752 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LalbaP29752 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LalbaP29752 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LalbaP29752 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LalbaP29752 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LalbaP29752 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LalbaP29752 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LalbaP29752 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LalbaP29752 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LalbaP29752 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LalbaP29752 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LalbaP29752 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LalbaP29752 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LalbaP29752 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LalbaP29752 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LalbaP29752 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LalbaP29752 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LalbaP29752 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LalbaP29752 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LalbaP29752 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LalbaP29752 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LalbaP29752 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LalbaP29752 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LalbaP29752 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LalbaP29752 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LalbaP29752 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LalbaP29752 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LalbaP29752 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LalbaP29752 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LalbaP29752 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LalbaP29752 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LalbaP29752 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LalbaP29752 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LalbaP29752 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LalbaP29752 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LalbaP29752 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LalbaP29752 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LalbaP29752 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LalbaP29752 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LalbaP29752 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LalbaP29752 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LalbaP29752 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LalbaP29752 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LalbaP29752 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LalbaP29752 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LalbaP29752 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LalbaP29752 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LalbaP29752 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LalbaP29752 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LalbaP29752 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LalbaP29752 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LalbaP29752 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LalbaP29752 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LalbaP29752 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LalbaP29752 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LalbaP29752 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LalbaP29752 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LalbaP29752 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LalbaP29752 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LalbaP29752 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LalbaP29752 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LalbaP29752 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LalbaP29752 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LalbaP29752 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LalbaP29752 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LalbaP29752 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LalbaP29752 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms