RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569745.5

CCNDBP1-215, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,356 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-215ENST00000569745 A0A1B0GV90 55 aa7.45□□□□□ -1.22
CCNDBP1-215ENST00000569745 KLKP1Q107X0 134 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 LINC00208Q96KT6 92 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 Q5VV11 94 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-215ENST00000569745 NDUFC1O43677 76 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT1BP07438 61 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 OCR1Q9BZK8 76 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 A8MUN3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 J3QR89 54 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 MP68P56378 58 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 IMUPQ9GZP8 106 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 CRIPTQ9P021 101 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-215ENST00000569745 A6NN06 94 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 H0YAA0 97 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 H3BPC8 53 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-215ENST00000569745 SCGB1A1P11684 91 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-215ENST00000569745 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP10-5P60370 271 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-215ENST00000569745 DMAC1Q96GE9 116 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-215ENST00000569745 NEBP20929 6669 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-215ENST00000569745 K7ERU9 68 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT-ATP8P03928 68 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-215ENST00000569745 C20orf197Q8N268 126 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 P0C880 135 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 R4GN34 69 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 ACYP2P14621 99 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-215ENST00000569745 PLAC4Q8WY50 150 aa6.95□□□□□ -1.3
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-215ENST00000569745 M0QZ58 72 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-215ENST00000569745 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT1XP80297 61 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP5-9P26371 169 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-215ENST00000569745 LINC01554Q52M75 96 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 SNURFQ9Y675 71 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 KMT2DO14686 5537 aa6.77□□□□□ -1.32
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 MDN1Q9NU22 5596 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 SERP2Q8N6R1 65 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP12-2P59991 146 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2EP22531 72 aa6.59□□□□□ -1.35
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2BP35325 72 aa6.59□□□□□ -1.35
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2AP35326 72 aa6.59□□□□□ -1.35
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 COX7CP15954 63 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 COA5Q86WW8 74 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP10-12P60413 245 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-215ENST00000569745 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 SEC61GP60059 68 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.46□□□□□ -1.37
CCNDBP1-215ENST00000569745 H7BZZ5 65 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-215ENST00000569745 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-215ENST00000569745 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPRR2DP22532 72 aa6.37□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 A0A1B0GU33 70 aa6.36□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 A0A0D9SG42 100 aa6.35□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.34□□□□□ -1.39
CCNDBP1-215ENST00000569745 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.31□□□□□ -1.4
CCNDBP1-215ENST00000569745 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.28□□□□□ -1.4
CCNDBP1-215ENST00000569745 A0A1B0GU69 56 aa6.25□□□□□ -1.41
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP12-1P59990 96 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-215ENST00000569745 LCE3BQ5TA77 95 aa6.2□□□□□ -1.42
CCNDBP1-215ENST00000569745 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-215ENST00000569745 CCDC179H3BU77 68 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-215ENST00000569745 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCNDBP1-215ENST00000569745 A8MU10 97 aa6.1□□□□□ -1.43
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT1EP04732 61 aa6.09□□□□□ -1.43
CCNDBP1-215ENST00000569745 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.06□□□□□ -1.44
CCNDBP1-215ENST00000569745 PRR15LQ9BU68 103 aa6.06□□□□□ -1.44
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.06□□□□□ -1.44
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-215ENST00000569745 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-215ENST00000569745 TMEM258P61165 79 aa5.95□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.95□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 TNP1P09430 55 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT1GP13640 62 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-215ENST00000569745 PP632Q6XCG6 107 aa5.88□□□□□ -1.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 UQCR11O14957 56 aa5.87□□□□□ -1.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 LCE3AQ5TA76 89 aa5.87□□□□□ -1.47
CCNDBP1-215ENST00000569745 MT1LQ93083 61 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms