RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-226ENST00000551430 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-226ENST00000551430 MT1BP07438 61 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-226ENST00000551430 KLKP1Q107X0 134 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-226ENST00000551430 LINC00208Q96KT6 92 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-226ENST00000551430 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-226ENST00000551430 J3QR89 54 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-226ENST00000551430 MP68P56378 58 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-226ENST00000551430 Q5VV11 94 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-226ENST00000551430 A8MUN3 132 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-226ENST00000551430 NDUFC1O43677 76 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-226ENST00000551430 IMUPQ9GZP8 106 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-226ENST00000551430 H0YAA0 97 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-226ENST00000551430 CRIPTQ9P021 101 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-226ENST00000551430 A6NN06 94 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-226ENST00000551430 H3BPC8 53 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-226ENST00000551430 SCGB1A1P11684 91 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-226ENST00000551430 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-226ENST00000551430 MT-ATP8P03928 68 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-226ENST00000551430 KRTAP10-5P60370 271 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-226ENST00000551430 DMAC1Q96GE9 116 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-226ENST00000551430 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-226ENST00000551430 K7ERU9 68 aa9□□□□□ -0.97
CS-226ENST00000551430 P0C880 135 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-226ENST00000551430 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-226ENST00000551430 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-226ENST00000551430 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-226ENST00000551430 NEBP20929 6669 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-226ENST00000551430 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-226ENST00000551430 R4GN34 69 aa8.83□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 C20orf197Q8N268 126 aa8.82□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 ACYP2P14621 99 aa8.81□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 MT1XP80297 61 aa8.81□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 M0QZ58 72 aa8.8□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 SNURFQ9Y675 71 aa8.8□□□□□ -1
CS-226ENST00000551430 KMT2DO14686 5537 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-226ENST00000551430 PLAC4Q8WY50 150 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-226ENST00000551430 KRTAP5-9P26371 169 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-226ENST00000551430 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-226ENST00000551430 MDN1Q9NU22 5596 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-226ENST00000551430 LINC01554Q52M75 96 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-226ENST00000551430 SERP2Q8N6R1 65 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-226ENST00000551430 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-226ENST00000551430 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-226ENST00000551430 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-226ENST00000551430 KRTAP12-2P59991 146 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-226ENST00000551430 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 COA5Q86WW8 74 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 COX7CP15954 63 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-226ENST00000551430 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-226ENST00000551430 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-226ENST00000551430 KRTAP10-12P60413 245 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-226ENST00000551430 H7BZZ5 65 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-226ENST00000551430 SPRR2EP22531 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-226ENST00000551430 SPRR2BP35325 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-226ENST00000551430 SPRR2AP35326 72 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-226ENST00000551430 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-226ENST00000551430 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-226ENST00000551430 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-226ENST00000551430 SEC61GP60059 68 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 A0A0D9SG42 100 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-226ENST00000551430 A0A1B0GU33 70 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-226ENST00000551430 CCDC179H3BU77 68 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-226ENST00000551430 SPRR2DP22532 72 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-226ENST00000551430 KRTAP12-1P59990 96 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-226ENST00000551430 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-226ENST00000551430 A0A1B0GU69 56 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-226ENST00000551430 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-226ENST00000551430 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-226ENST00000551430 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-226ENST00000551430 A8MU10 97 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-226ENST00000551430 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-226ENST00000551430 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-226ENST00000551430 LCE3BQ5TA77 95 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-226ENST00000551430 MT1EP04732 61 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-226ENST00000551430 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 PRR15LQ9BU68 103 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 TMEM258P61165 79 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-226ENST00000551430 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-226ENST00000551430 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-226ENST00000551430 LCE3AQ5TA76 89 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-226ENST00000551430 TNP1P09430 55 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-226ENST00000551430 MT1GP13640 62 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-226ENST00000551430 MT1LQ93083 61 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-226ENST00000551430 UQCR11O14957 56 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-226ENST00000551430 MT1MQ8N339 61 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-226ENST00000551430 PP632Q6XCG6 107 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-226ENST00000551430 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms