RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 C4orf26Q17RF5 130 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-205ENST00000502260 MP68P56378 58 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 H3BPC8 53 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 SERP2Q8N6R1 65 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC00208Q96KT6 92 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 NEBP20929 6669 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-205ENST00000502260 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP2-205ENST00000502260 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP2-205ENST00000502260 COX7CP15954 63 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP2-205ENST00000502260 C20orf197Q8N268 126 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP2-205ENST00000502260 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-205ENST00000502260 KLKP1Q107X0 134 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-205ENST00000502260 SNURFQ9Y675 71 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-205ENST00000502260 S4R3F8 94 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-205ENST00000502260 CSAG1Q6PB30 78 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 LCA10Q71F78 164 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 A6NN06 94 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC179H3BU77 68 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 MT1BP07438 61 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-205ENST00000502260 NDUFC1O43677 76 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 A8MUN3 132 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 Q5VV11 94 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-205ENST00000502260 H7BZZ5 65 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP5-9P26371 169 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP10-5P60370 271 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 DMAC1Q96GE9 116 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 PCP4P48539 62 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 KMT2DO14686 5537 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 ACYP2P14621 99 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-205ENST00000502260 MDN1Q9NU22 5596 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM258P61165 79 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-205ENST00000502260 CRIPTQ9P021 101 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP2-205ENST00000502260 H0YAA0 97 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP2-205ENST00000502260 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP2-205ENST00000502260 COA5Q86WW8 74 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP2-205ENST00000502260 ADM2Q7Z4H4 148 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-205ENST00000502260 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2EP22531 72 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2BP35325 72 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2AP35326 72 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP2-205ENST00000502260 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP2-205ENST00000502260 P0C880 135 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP2-205ENST00000502260 R4GN34 69 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 M0QZ58 72 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 MT1XP80297 61 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 PLAC4Q8WY50 150 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SH3BP2-205ENST00000502260 SEC61GP60059 68 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC01554Q52M75 96 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP12-2P59991 146 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP2-205ENST00000502260 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1B0GU69 56 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 SPRR2DP22532 72 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 V9GYY9 64 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PRR15LQ9BU68 103 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 Q1T7F1 81 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1B0GU33 70 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP2-205ENST00000502260 LCE3BQ5TA77 95 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP2-205ENST00000502260 PSPHP1O15172 72 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP10-12P60413 245 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-205ENST00000502260 UQCR11O14957 56 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP2-205ENST00000502260 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A0D9SG42 100 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 A6NED7 52 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 A8MU10 97 aa5.39□□□□□ -1.55
SH3BP2-205ENST00000502260 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP12-1P59990 96 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP2-205ENST00000502260 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP2-205ENST00000502260 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.27□□□□□ -1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.25□□□□□ -1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 K7ERS5 55 aa5.24□□□□□ -1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms