RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A1	P23297	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NREP	Q16612	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511		S4R3F8	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GW54	56 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MU10	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD52	Q0P140	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5W150	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EQZ3	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE6G	P18545	87 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	LCA10	Q71F78	164 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR2D	P22532	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	BPY2	O14599	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL6	P80162	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N9L7	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MUN3	132 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1X	P80297	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WVE0	104 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R143	59 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFC1	O43677	76 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YAA0	97 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BT86	120 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SKAP2-209	ENST00000497511	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SKAP2-209	ENST00000497511		R4GN34	69 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EP34	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	BATF	Q16520	125 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QZ58	72 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ACYP1	P07311	99 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPM0	123 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SKAP2-209	ENST00000497511		P0C880	135 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y9P7	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ATOX1	O00244	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRQ	O14949	82 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-209	ENST00000497511	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MT4	P47944	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MP68	P56378	58 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1E	P04732	61 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	DMAC1	Q96GE9	116 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SKAP2-209	ENST00000497511	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W1H4	67 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1G	P13640	62 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		3.92	□□□□□ -1.78

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