RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 IGKV2-30P06310 120 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-209ENST00000488426 A6NED7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-209ENST00000488426 TPRXLQ17RH7 258 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 PCOTHQ58A44 107 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 MUC17Q685J3 4493 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 XP32Q5T750 250 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 H3BS24 57 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-209ENST00000488426 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-209ENST00000488426 COA5Q86WW8 74 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-209ENST00000488426 HRES1P13985 223 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-209ENST00000488426 LINC01554Q52M75 96 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-209ENST00000488426 SPINK7P58062 85 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-209ENST00000488426 DMAC1Q96GE9 116 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-209ENST00000488426 PRAC1Q96KF2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 ACYP2P14621 99 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NELFE-209ENST00000488426 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-209ENST00000488426 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-209ENST00000488426 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-209ENST00000488426 LCE2CQ5TA81 110 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-209ENST00000488426 CSAG1Q6PB30 78 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-209ENST00000488426 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-209ENST00000488426 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-209ENST00000488426 MT1HP80294 61 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-209ENST00000488426 S4R3F8 94 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-209ENST00000488426 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NELFE-209ENST00000488426 UQCR11O14957 56 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GU69 56 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-209ENST00000488426 ROMO1P60602 79 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-209ENST00000488426 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.23□□□□□ -1.41
NELFE-209ENST00000488426 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
NELFE-209ENST00000488426 M0R2T5 61 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFE-209ENST00000488426 P0C880 135 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-209ENST00000488426 H0YAA0 97 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-209ENST00000488426 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GU33 70 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-209ENST00000488426 USH2AO75445 5202 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFE-209ENST00000488426 MT2AP02795 61 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-209ENST00000488426 SSPOA2VEC9 5147 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFE-209ENST00000488426 A0A0A0MQY5 61 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFE-209ENST00000488426 M0QZ58 72 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.9□□□□□ -1.47
NELFE-209ENST00000488426 MT1FP04733 61 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-209ENST00000488426 R4GN34 69 aa5.84□□□□□ -1.47
NELFE-209ENST00000488426 LCE2BO14633 110 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.82□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 CRIPTQ9P021 101 aa5.81□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 NDUFAF8A1L188 74 aa5.8□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-10P60014 251 aa5.8□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 K7ERS5 55 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 A0A0D9SG42 100 aa5.78□□□□□ -1.48
NELFE-209ENST00000488426 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-209ENST00000488426 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP12-1P59990 96 aa5.69□□□□□ -1.5
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP12-2P59991 146 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-209ENST00000488426 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.61□□□□□ -1.51
NELFE-209ENST00000488426 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.56□□□□□ -1.52
NELFE-209ENST00000488426 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
NELFE-209ENST00000488426 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
NELFE-209ENST00000488426 LUZP6Q538Z0 58 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.51□□□□□ -1.53
NELFE-209ENST00000488426 PLAC4Q8WY50 150 aa5.48□□□□□ -1.53
NELFE-209ENST00000488426 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.47□□□□□ -1.53
NELFE-209ENST00000488426 MT1BP07438 61 aa5.41□□□□□ -1.54
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.28□□□□□ -1.56
NELFE-209ENST00000488426 MT1XP80297 61 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-5P60370 271 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-209ENST00000488426 TNP1P09430 55 aa5.23□□□□□ -1.57
NELFE-209ENST00000488426 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.22□□□□□ -1.57
NELFE-209ENST00000488426 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.21□□□□□ -1.57
NELFE-209ENST00000488426 NEBP20929 6669 aa5.15□□□□□ -1.58
NELFE-209ENST00000488426 KMT2DO14686 5537 aa5.13□□□□□ -1.59
NELFE-209ENST00000488426 PP632Q6XCG6 107 aa5.12□□□□□ -1.59
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.11□□□□□ -1.59
NELFE-209ENST00000488426 MDN1Q9NU22 5596 aa5.05□□□□□ -1.6
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP5-9P26371 169 aa5.04□□□□□ -1.6
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-12P60413 245 aa5□□□□□ -1.61
NELFE-209ENST00000488426 LCE3AQ5TA76 89 aa4.98□□□□□ -1.61
NELFE-209ENST00000488426 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.95□□□□□ -1.62
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms