RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00208Q96KT6 92 aa10.77□□□□□ -0.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 MT1BP07438 61 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.7□□□□□ -0.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 Q5VV11 94 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-208ENST00000459627 J3QR89 54 aa10.64□□□□□ -0.71
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SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFC1O43677 76 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP5-208ENST00000459627 R4GN34 69 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.15□□□□□ -0.78
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SH3BP5-208ENST00000459627 C20orf197Q8N268 126 aa10.1□□□□□ -0.79
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SH3BP5-208ENST00000459627 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.96□□□□□ -0.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.69□□□□□ -0.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.67□□□□□ -0.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.59□□□□□ -0.87
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SH3BP5-208ENST00000459627 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.38□□□□□ -0.91
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SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GU33 70 aa9.26□□□□□ -0.93
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SH3BP5-208ENST00000459627 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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SH3BP5-208ENST00000459627 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR15LQ9BU68 103 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM258P61165 79 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3AQ5TA76 89 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP5-208ENST00000459627 TNP1P09430 55 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP5-208ENST00000459627 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1GP13640 62 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 UQCR11O14957 56 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1LQ93083 61 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1MQ8N339 61 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.47□□□□□ -1.05
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