RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426343.5

HDLBP-212, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-212ENST00000426343 A0A087WVE0 104 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 UQCRQO14949 82 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 CRIPTQ9P021 101 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 ATOX1O00244 68 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 H0Y9P7 68 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP10-5P60370 271 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 IMUPQ9GZP8 106 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-212ENST00000426343 NDUFC1O43677 76 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-212ENST00000426343 H0YAA0 97 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-212ENST00000426343 A8MUN3 132 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-212ENST00000426343 LINC00643Q86TS7 51 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-212ENST00000426343 LINC00208Q96KT6 92 aa7.71□□□□□ -1.18
HDLBP-212ENST00000426343 MP68P56378 58 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-212ENST00000426343 NEBP20929 6669 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-212ENST00000426343 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-212ENST00000426343 OCR1Q9BZK8 76 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-212ENST00000426343 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.65□□□□□ -1.19
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP5-9P26371 169 aa7.61□□□□□ -1.19
HDLBP-212ENST00000426343 H3BPC8 53 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-212ENST00000426343 A0A1B0GV90 55 aa7.55□□□□□ -1.2
HDLBP-212ENST00000426343 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 J3QR89 54 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 KMT2DO14686 5537 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 C20orf197Q8N268 126 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 PLAC4Q8WY50 150 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 DMAC1Q96GE9 116 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 R4GN34 69 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 SCGB1A1P11684 91 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 MT1XP80297 61 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-212ENST00000426343 P0C880 135 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-212ENST00000426343 MDN1Q9NU22 5596 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-212ENST00000426343 M0QZ58 72 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-212ENST00000426343 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-212ENST00000426343 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP12-2P59991 146 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-212ENST00000426343 ACYP2P14621 99 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-212ENST00000426343 LINC01554Q52M75 96 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 SPRR2EP22531 72 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 SPRR2BP35325 72 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 SPRR2AP35326 72 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-212ENST00000426343 MT-ATP8P03928 68 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-212ENST00000426343 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-212ENST00000426343 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-212ENST00000426343 K7ERU9 68 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP10-12P60413 245 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-212ENST00000426343 SNURFQ9Y675 71 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-212ENST00000426343 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-212ENST00000426343 SPRR2DP22532 72 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-212ENST00000426343 SERP2Q8N6R1 65 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-212ENST00000426343 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-212ENST00000426343 LCE3BQ5TA77 95 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-212ENST00000426343 COA5Q86WW8 74 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-212ENST00000426343 SEC61GP60059 68 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-212ENST00000426343 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-212ENST00000426343 A0A0D9SG42 100 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-212ENST00000426343 COX7CP15954 63 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-212ENST00000426343 A0A1B0GU33 70 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-212ENST00000426343 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-212ENST00000426343 MT1EP04732 61 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-212ENST00000426343 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-212ENST00000426343 H7BZZ5 65 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-212ENST00000426343 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP12-1P59990 96 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-212ENST00000426343 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-212ENST00000426343 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-212ENST00000426343 A0A1B0GU69 56 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-212ENST00000426343 MT1GP13640 62 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-212ENST00000426343 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-212ENST00000426343 A8MU10 97 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-212ENST00000426343 PP632Q6XCG6 107 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-212ENST00000426343 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-212ENST00000426343 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-212ENST00000426343 TNP1P09430 55 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 MT1MQ8N339 61 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 MT1LQ93083 61 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 LCE3AQ5TA76 89 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 PRR15LQ9BU68 103 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-212ENST00000426343 CCDC179H3BU77 68 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-212ENST00000426343 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-212ENST00000426343 LCE1DQ5T752 114 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-212ENST00000426343 LCE4AQ5TA78 99 aa6.22□□□□□ -1.41
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