RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATXN8Q156A1 80 aa6.7□□□□□ -1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8N9L7 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WVE0 104 aa6.6□□□□□ -1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-12P60413 245 aa6.58□□□□□ -1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFC1O43677 76 aa6.57□□□□□ -1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.57□□□□□ -1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE1DQ5T752 114 aa6.51□□□□□ -1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.5□□□□□ -1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 R4GN34 69 aa6.5□□□□□ -1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.46□□□□□ -1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.46□□□□□ -1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.41□□□□□ -1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.4□□□□□ -1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0QZ58 72 aa6.39□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.39□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf197Q8N268 126 aa6.38□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSTD3H0UI37 97 aa6.34□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BT86 120 aa6.34□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE4AQ5TA78 99 aa6.34□□□□□ -1.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7EP34 96 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT4P47944 62 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01554Q52M75 96 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PYY3Q5JQD4 70 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.33□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACYP1P07311 99 aa6.31□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P0C880 135 aa6.3□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBL5Q9BZL1 73 aa6.3□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.29□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.29□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R143 59 aa6.28□□□□□ -1.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.26□□□□□ -1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.22□□□□□ -1.41
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.18□□□□□ -1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1EP04732 61 aa6.17□□□□□ -1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BATFQ16520 125 aa6.16□□□□□ -1.42
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.12□□□□□ -1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.11□□□□□ -1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATOX1O00244 68 aa6.1□□□□□ -1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT-ATP8P03928 68 aa6.09□□□□□ -1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.09□□□□□ -1.43
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1GP13640 62 aa6.08□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.07□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PP632Q6XCG6 107 aa6.07□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.06□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.04□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0Y9P7 68 aa6.04□□□□□ -1.44
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPM0 123 aa6.02□□□□□ -1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UQCRQO14949 82 aa6.02□□□□□ -1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf118A6NHY6 69 aa6.01□□□□□ -1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAX1BP3O14907 124 aa5.97□□□□□ -1.45
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1MQ8N339 61 aa5.93□□□□□ -1.46
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00208Q96KT6 92 aa5.89□□□□□ -1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.87□□□□□ -1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.85□□□□□ -1.47
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMAC1Q96GE9 116 aa5.81□□□□□ -1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO0461Q9UI25 63 aa5.8□□□□□ -1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.78□□□□□ -1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1LQ93083 61 aa5.78□□□□□ -1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0D9SG42 100 aa5.77□□□□□ -1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MP68P56378 58 aa5.77□□□□□ -1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.77□□□□□ -1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.7□□□□□ -1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.69□□□□□ -1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.68□□□□□ -1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM6P0DI80 62 aa5.62□□□□□ -1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BPC8 53 aa5.6□□□□□ -1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OCR1Q9BZK8 76 aa5.6□□□□□ -1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP12-4P60329 112 aa5.59□□□□□ -1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ETDBQ3ZM63 59 aa5.59□□□□□ -1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.58□□□□□ -1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACYP2P14621 99 aa5.57□□□□□ -1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8W1H4 67 aa5.55□□□□□ -1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.47□□□□□ -1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.47□□□□□ -1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.47□□□□□ -1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.46□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.46□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.45□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.43□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC5ACP98088 5654 aa5.42□□□□□ -1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCE3AQ5TA76 89 aa5.38□□□□□ -1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00643Q86TS7 51 aa5.38□□□□□ -1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.36□□□□□ -1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-8O75690 187 aa5.29□□□□□ -1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1A1P11684 91 aa5.25□□□□□ -1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNP1P09430 55 aa5.23□□□□□ -1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP12-1P59990 96 aa5.23□□□□□ -1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP12-3P60328 96 aa5.19□□□□□ -1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.19□□□□□ -1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.19□□□□□ -1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms