RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 A8MUN3 132 aa7.85□□□□□ -1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PLAC4Q8WY50 150 aa7.85□□□□□ -1.15
HOXD12-201ENST00000404162 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.8□□□□□ -1.16
HOXD12-201ENST00000404162 H0YAA0 97 aa7.79□□□□□ -1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PYY3Q5JQD4 70 aa7.78□□□□□ -1.16
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.78□□□□□ -1.16
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HOXD12-201ENST00000404162 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.73□□□□□ -1.17
HOXD12-201ENST00000404162 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFC1O43677 76 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP10-12P60413 245 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD12-201ENST00000404162 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD12-201ENST00000404162 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXD12-201ENST00000404162 K7EP34 96 aa7.59□□□□□ -1.19
HOXD12-201ENST00000404162 H3BT86 120 aa7.58□□□□□ -1.2
HOXD12-201ENST00000404162 TSTD3H0UI37 97 aa7.57□□□□□ -1.2
HOXD12-201ENST00000404162 R4GN34 69 aa7.56□□□□□ -1.2
HOXD12-201ENST00000404162 M0R143 59 aa7.53□□□□□ -1.2
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1DQ5T752 114 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXD12-201ENST00000404162 M0QZ58 72 aa7.48□□□□□ -1.21
HOXD12-201ENST00000404162 P0C880 135 aa7.48□□□□□ -1.21
HOXD12-201ENST00000404162 UBL5Q9BZL1 73 aa7.47□□□□□ -1.21
HOXD12-201ENST00000404162 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.46□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.44□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01554Q52M75 96 aa7.44□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ACYP1P07311 99 aa7.39□□□□□ -1.23
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf197Q8N268 126 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXD12-201ENST00000404162 MT4P47944 62 aa7.32□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPM0 123 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf118A6NHY6 69 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 BATFQ16520 125 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM6P0DI80 62 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXD12-201ENST00000404162 LCE4AQ5TA78 99 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXD12-201ENST00000404162 TAX1BP3O14907 124 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD12-201ENST00000404162 H0Y9P7 68 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD12-201ENST00000404162 MT1EP04732 61 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXD12-201ENST00000404162 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXD12-201ENST00000404162 ATOX1O00244 68 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXD12-201ENST00000404162 UQCRQO14949 82 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXD12-201ENST00000404162 MT-ATP8P03928 68 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXD12-201ENST00000404162 PRO0461Q9UI25 63 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00208Q96KT6 92 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXD12-201ENST00000404162 MT1GP13640 62 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7□□□□□ -1.29
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD12-201ENST00000404162 PP632Q6XCG6 107 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD12-201ENST00000404162 MT1MQ8N339 61 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HOXD12-201ENST00000404162 DMAC1Q96GE9 116 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXD12-201ENST00000404162 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD12-201ENST00000404162 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD12-201ENST00000404162 MP68P56378 58 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD12-201ENST00000404162 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXD12-201ENST00000404162 ETDBQ3ZM63 59 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD12-201ENST00000404162 MT1LQ93083 61 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0D9SG42 100 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD12-201ENST00000404162 OCR1Q9BZK8 76 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GV90 55 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 F8W1H4 67 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD12-201ENST00000404162 H3BPC8 53 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD12-201ENST00000404162 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD12-201ENST00000404162 ACYP2P14621 99 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD12-201ENST00000404162 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00643Q86TS7 51 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD12-201ENST00000404162 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HOXD12-201ENST00000404162 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP12-4P60329 112 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXD12-201ENST00000404162 LCE3AQ5TA76 89 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXD12-201ENST00000404162 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXD12-201ENST00000404162 SCGB1A1P11684 91 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD12-201ENST00000404162 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 J3QR89 54 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP12-1P59990 96 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 K7ERU9 68 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD12-201ENST00000404162 MUC5ACP98088 5654 aa6.2□□□□□ -1.42
HOXD12-201ENST00000404162 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms