RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14214V9GX35 225 aa15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm10553J3QPF1 123 aa15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Srp14P16254 110 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Odf3Q920N1 254 aa15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 UrahQ9CRB3 118 aa15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AplnrQ9WV08 377 aa15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myo18bE9PV66 2605 aa15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm20379A0A087WR34 119 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp930A0A1D5RM15 441 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hist1h2bfP10853 126 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hist1h2bbQ64475 126 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5105Q8C6Y9 112 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nav3Q80TN7 2359 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ang5Q5GAN1 145 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fa2hQ5MPP0 372 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pdzd11Q9CZG9 140 aa15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5150Q1AN92 299 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Foxc2Q61850 494 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Megf10Q6DIB5 1147 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf183Q8QZS5 190 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr983Q8VG90 315 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr954Q9EQB6 314 aa15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1437Q7TQR7 312 aa15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01750 117 aa15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2-DMb2Q31099 261 aa15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nf1Q04690 2841 aa15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnase1P00683 149 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01739 132 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-62-3P01754 117 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Runx1Q03347 451 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem140Q8BGY5 185 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RhohQ9D3G9 191 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9D7E4 109 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9602J3QPD5 205 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Megf9Q8BH27 600 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tenm3Q9WTS6 2715 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 A930009A15RikG3UYI6 118 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wfdc15aQ8BH89 80 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm11733Q8BQP1 125 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9944Q8C559 102 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ucn2Q99ML8 113 aa15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r1E9PVR6 306 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r149E9PWL6 307 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r101E9Q365 307 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vsig8Q6P3A4 417 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr365Q8VFT2 312 aa15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rif1Q6PR54 2419 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nit2Q9JHW2 276 aa15.07■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TcapO70548 167 aa15.07■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa15.07■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BsnO88737 3942 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psmb8P28063 276 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem241Q3UME2 297 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CnfnQ6PCW6 111 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Epg5Q80TA9 2572 aa15.06■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6176J3QK59 301 aa15.05■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm4567Q3UTA8 301 aa15.05■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arl11Q6P3A9 176 aa15.05■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1431Q8VF59 312 aa15.05■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2l6Q9QZU9 153 aa15.05■□□□□ 0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa15.05■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav14-3A0A075B607 120 aa15.05■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa15.05■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dusp14Q9JLY7 198 aa15.05■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ramp1Q9WTJ5 148 aa15.05■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Foxi3E0CZH3 425 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 7420426K07RikQ3UX66 186 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pafah1b2Q61206 229 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cd99Q8VCN6 175 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TctaQ8VEA7 122 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klk7Q91VE3 249 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Timm10bQ9WV96 100 aa15.04■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnfrsf9P20334 256 aa15.03■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2al1nQ497L1 109 aa15.03■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa15.03■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TroQ6DIC6 2087 aa15.02■□□□□ -0
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Obox1Q9D350 204 aa15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 102.8 ms