Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ramp1Q9WTJ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ramp1Q9WTJ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ramp1Q9WTJ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ramp1Q9WTJ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ramp1Q9WTJ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ramp1Q9WTJ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ramp1Q9WTJ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ramp1Q9WTJ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ramp1Q9WTJ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ramp1Q9WTJ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ramp1Q9WTJ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ramp1Q9WTJ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ramp1Q9WTJ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ramp1Q9WTJ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ramp1Q9WTJ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ramp1Q9WTJ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ramp1Q9WTJ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ramp1Q9WTJ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ramp1Q9WTJ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ramp1Q9WTJ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ramp1Q9WTJ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ramp1Q9WTJ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ramp1Q9WTJ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ramp1Q9WTJ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ramp1Q9WTJ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ramp1Q9WTJ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ramp1Q9WTJ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ramp1Q9WTJ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ramp1Q9WTJ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ramp1Q9WTJ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ramp1Q9WTJ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ramp1Q9WTJ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ramp1Q9WTJ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ramp1Q9WTJ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ramp1Q9WTJ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ramp1Q9WTJ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ramp1Q9WTJ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ramp1Q9WTJ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ramp1Q9WTJ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ramp1Q9WTJ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ramp1Q9WTJ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ramp1Q9WTJ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ramp1Q9WTJ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ramp1Q9WTJ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ramp1Q9WTJ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ramp1Q9WTJ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ramp1Q9WTJ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ramp1Q9WTJ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ramp1Q9WTJ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ramp1Q9WTJ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ramp1Q9WTJ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ramp1Q9WTJ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ramp1Q9WTJ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ramp1Q9WTJ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ramp1Q9WTJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ramp1Q9WTJ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ramp1Q9WTJ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ramp1Q9WTJ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ramp1Q9WTJ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ramp1Q9WTJ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ramp1Q9WTJ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ramp1Q9WTJ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ramp1Q9WTJ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ramp1Q9WTJ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ramp1Q9WTJ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ramp1Q9WTJ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ramp1Q9WTJ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ramp1Q9WTJ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ramp1Q9WTJ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ramp1Q9WTJ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ramp1Q9WTJ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ramp1Q9WTJ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ramp1Q9WTJ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ramp1Q9WTJ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ramp1Q9WTJ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ramp1Q9WTJ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ramp1Q9WTJ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ramp1Q9WTJ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ramp1Q9WTJ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ramp1Q9WTJ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms