RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Odf1Q61999 247 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem177Q8BPE4 311 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10118Q8C8J5 116 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1402Q8VET1 320 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Golt1bQ9CR60 138 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plekhb2Q9QZC7 221 aa14.85□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q4KKZ1 196 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp248Q640N4 576 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wfdc15aQ8BH89 80 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rasl10aQ8K5A4 203 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Krtap26-1Q9D7N2 215 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tctex1d4Q8CDY7 219 aa14.84□□□□□ -0.03
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm4565A0A140LJ87 301 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm7849D3YX03 116 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm6176J3QK59 301 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Itgb1bp1O35671 200 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rab24P35290 203 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm4567Q3UTA8 301 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pafah1b2Q61206 229 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm5105Q8C6Y9 112 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q9CR34 168 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr954Q9EQB6 314 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setd2E9Q5F9 2537 aa14.83□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rhox7bA6PW38 321 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sub1P11031 127 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Muc15Q8C6Z1 331 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ufc1Q9CR09 167 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Xirp2Q4U4S6 3784 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm20379A0A087WR34 119 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fbxl7Q5BJ29 491 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nrn1Q8CFV4 142 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1404Q8VGE1 313 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q9DAB9 146 aa14.82□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ang5Q5GAN1 145 aa14.81□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm9944Q8C559 102 aa14.81□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cd99Q8VCN6 175 aa14.81□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 GlmpQ9JHJ3 404 aa14.81□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Timm10bQ9WV96 100 aa14.81□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 CebpgP53568 150 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm11733Q8BQP1 125 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 UrahQ9CRB3 118 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 SelenokQ9JLJ1 94 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3250E9Q1M3 230 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnase1P00683 149 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 H2-DMb2Q31099 261 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Foxc2Q61850 494 aa14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm10842Q3U587 122 aa14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem140Q8BGY5 185 aa14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spcs1Q9D958 161 aa14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nat6Q9R123 314 aa14.79□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 A930009A15RikG3UYI6 118 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf183Q8QZS5 190 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc25a2Q99ML6 265 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ucn2Q99ML8 113 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 QrfpQ8CE23 124 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Klk10Q99M20 278 aa14.78□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav16nA0A075B634 117 aa14.77□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa14.77□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn1r1E9PVR6 306 aa14.77□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-62-3P01754 117 aa14.77□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa14.77□□□□□ -0.04
Msx1-201ENSMUST00000063116 Akap13E9Q394 2776 aa14.77□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 CicQ924A2 2510 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1245A0A1L1SQJ6 307 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp5iQ06185 71 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc35d2Q762D5 326 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nudt3Q9JI46 168 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Crlf1Q9JM58 425 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wnk1P83741 2377 aa14.76□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa14.75□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 P01750 117 aa14.75□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tenm4Q3UHK6 2771 aa14.75□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ang6Q5GAN0 147 aa14.75□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm5218F6YH22 154 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 P01739 132 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rps20P60867 119 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 SbsponQ3UPR9 264 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Acrv1P50289 261 aa14.74□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trav14-3A0A075B607 120 aa14.73□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa14.73□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr1339Q8VGB1 315 aa14.73□□□□□ -0.05
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ramp1Q9WTJ5 148 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.3 ms