RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 CCKP06307 115 aa3.7□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 DSCR8Q96T75 97 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 C9JAW5 83 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ERU9 68 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 PCOTHQ58A44 107 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 Q96NJ1 140 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV4-1P06312 121 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0U1RQV1 116 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 PCP4P48539 62 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 MTURNQ8N3F0 131 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 SIGMAR1Q99720 223 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 F8W1H4 67 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 DSCR10P59022 87 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZQT0 140 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 PRO0461Q9UI25 63 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.63□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00313P59037 77 aa3.63□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC17Q685J3 4493 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BT86 120 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE6GP18545 87 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF213Q63HN8 5207 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 J3QR89 54 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 ETDBQ3ZM63 59 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 Q75L30 129 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GW54 56 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MUU9 505 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 NREPQ16612 68 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GVX0 72 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 J3KT08 172 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC2Q02817 5179 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFB1O75438 58 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf87E5RJ46 101 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 SCGB1A1P11684 91 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MWP4 228 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-211ENST00000588374 BPY2O14599 106 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZVQ6 151 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR15Q8IV56 129 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 K7EQZ3 153 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-ATP8P03928 68 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00846Q9NV44 126 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1HP80294 61 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N9L7 120 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 UBL5Q9BZL1 73 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 hDV103S1A0JD37 113 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 M0R2T5 61 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFS5O43920 106 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.46□□□□□ -1.85
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM236CP0DP71 79 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 HRES1P13985 223 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK7P58062 85 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CASC2Q6XLA1 102 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 ACYP1P07311 99 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 HCG22E2RYF7 251 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 Q5W150 140 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BS24 57 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCL6P80162 114 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2-30P06310 120 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00643Q86TS7 51 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 IMUPQ9GZP8 106 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC179H3BU77 68 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-211ENST00000588374 SVIPQ8NHG7 77 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms