RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 Q96NJ1 140 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 SPINK1P00995 79 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 IGKV4-1P06312 121 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WVE0 104 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 A8MWP4 228 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 LIMD2Q9BT23 127 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 PRR15Q8IV56 129 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-217ENST00000583667 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 K7EQZ3 153 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 ATOX1O00244 68 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 NDUFB1O75438 58 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 Q8N9L7 120 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 PCP4P48539 62 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 C1orf195Q5TG92 126 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GVX0 72 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 HCG22E2RYF7 251 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 SERP2Q8N6R1 65 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 C8orf87E5RJ46 101 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 OCR1Q9BZK8 76 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-217ENST00000583667 COX7CP15954 63 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 CASC2Q6XLA1 102 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 PRR4Q16378 134 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 hDV103S1A0JD37 113 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 UQCRQO14949 82 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 LINC00313P59037 77 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-217ENST00000583667 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 MUC17Q685J3 4493 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 C5orf47Q569G3 176 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 CCDC179H3BU77 68 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 KLKP1Q107X0 134 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-217ENST00000583667 H3BPC8 53 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-217ENST00000583667 C20orf197Q8N268 126 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-217ENST00000583667 MP68P56378 58 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-217ENST00000583667 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GGA3-217ENST00000583667 NDUFC1O43677 76 aa6.53□□□□□ -1.36
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GGA3-217ENST00000583667 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 A8MUU9 505 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 NDUFS5O43920 106 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 H0Y9P7 68 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 Q5W150 140 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 SNURFQ9Y675 71 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-217ENST00000583667 H7BZZ5 65 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 LINC00208Q96KT6 92 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 Q75L30 129 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 C9orf92A6NGG3 77 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 TMEM258P61165 79 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 TPRXLQ17RH7 258 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-217ENST00000583667 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2-30P06310 120 aa6.38□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.38□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 XP32Q5T750 250 aa6.37□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 LCE2CQ5TA81 110 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-217ENST00000583667 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 FAM236CP0DP71 79 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 SSPOA2VEC9 5147 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 MT1HP80294 61 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 USH2AO75445 5202 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 PCOTHQ58A44 107 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.26□□□□□ -1.41
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