RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 IGFL1Q6UW32 110 aa5.25□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00846Q9NV44 126 aa5.25□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.24□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.22□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.22□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 M0R2T5 61 aa5.22□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 MT1HP80294 61 aa5.22□□□□□ -1.57
SMAD3-215ENST00000560424 ATOX1O00244 68 aa5.21□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 CD164Q04900 197 aa5.21□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 NREPQ16612 68 aa5.21□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.2□□□□□ -1.58
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SMAD3-215ENST00000560424 MOBPQ13875 183 aa5.2□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 LCE2CQ5TA81 110 aa5.2□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.2□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZVQ6 151 aa5.19□□□□□ -1.58
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SMAD3-215ENST00000560424 CCDC179H3BU77 68 aa5.17□□□□□ -1.58
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SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WSZ3 146 aa5.16□□□□□ -1.58
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SMAD3-215ENST00000560424 Q5XG85 94 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.16□□□□□ -1.58
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0G2JQZ4 141 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-215ENST00000560424 SPINK1P00995 79 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-215ENST00000560424 BPY2O14599 106 aa5.14□□□□□ -1.59
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SMAD3-215ENST00000560424 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-215ENST00000560424 J3KT08 172 aa5.11□□□□□ -1.59
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SMAD3-215ENST00000560424 Q96NJ1 140 aa5.09□□□□□ -1.59
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SMAD3-215ENST00000560424 A8MWP4 228 aa5.05□□□□□ -1.6
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM258P61165 79 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-215ENST00000560424 K7EQZ3 153 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf195Q5TG92 126 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf92A6NGG3 77 aa5.01□□□□□ -1.61
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SMAD3-215ENST00000560424 C20orf197Q8N268 126 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD3-215ENST00000560424 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.96□□□□□ -1.62
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SMAD3-215ENST00000560424 C5orf47Q569G3 176 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 CASC2Q6XLA1 102 aa4.94□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 OCR1Q9BZK8 76 aa4.94□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.93□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 hDV103S1A0JD37 113 aa4.93□□□□□ -1.62
SMAD3-215ENST00000560424 MP68P56378 58 aa4.93□□□□□ -1.62
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.93□□□□□ -1.62
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.91□□□□□ -1.62
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM236CP0DP71 79 aa4.91□□□□□ -1.62
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SMAD3-215ENST00000560424 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.9□□□□□ -1.63
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SMAD3-215ENST00000560424 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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SMAD3-215ENST00000560424 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.88□□□□□ -1.63
SMAD3-215ENST00000560424 SVIPQ8NHG7 77 aa4.87□□□□□ -1.63
SMAD3-215ENST00000560424 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.86□□□□□ -1.63
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.86□□□□□ -1.63
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.84□□□□□ -1.63
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.84□□□□□ -1.63
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