RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PNM2 257 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 FAM236CP0DP71 79 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 PCP4P48539 62 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 HSD52Q0P140 79 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 SIGMAR1Q99720 223 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.12□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 IGKV4-1P06312 121 aa4.11□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.11□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.11□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.1□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 H3BQ85 93 aa4.1□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 BATFQ16520 125 aa4.1□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 CEND1Q8N111 149 aa4.1□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.09□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.09□□□□□ -1.75
COCH-211ENST00000557065 DNAL4O96015 105 aa4.08□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 MT2AP02795 61 aa4.08□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.08□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.07□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.07□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 KRTAP10-10P60014 251 aa4.07□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.07□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GV72 72 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GV90 55 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 TRACP01848 142 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 CCKP06307 115 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 COX6CP09669 75 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 HRES1P13985 223 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 PSMB2P49721 201 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 MTURNQ8N3F0 131 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.06□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 MT1FP04733 61 aa4.04□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 FXYD2P54710 66 aa4.04□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 C8orf87E5RJ46 101 aa4.03□□□□□ -1.76
COCH-211ENST00000557065 SSPOA2VEC9 5147 aa4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 USH2AO75445 5202 aa4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 TAX1BP3O14907 124 aa4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 UBE2V1Q13404 147 aa4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 VPS25Q9BRG1 176 aa4.02□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GVX0 72 aa4.01□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.01□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 J3KT08 172 aa4□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 K7ERJ3 54 aa4□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 SPINK7P58062 85 aa4□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 DSCR8Q96T75 97 aa4□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.99□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.99□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 LINC00846Q9NV44 126 aa3.99□□□□□ -1.77
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPM0 123 aa3.98□□□□□ -1.77
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COCH-211ENST00000557065 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.96□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 A8MWP4 228 aa3.95□□□□□ -1.78
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COCH-211ENST00000557065 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.93□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 A0A0A0MQY5 61 aa3.92□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GW54 56 aa3.92□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.92□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.92□□□□□ -1.78
COCH-211ENST00000557065 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.91□□□□□ -1.78
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COCH-211ENST00000557065 Q6ZVQ6 151 aa3.9□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.89□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 F8W1H4 67 aa3.89□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 NREPQ16612 68 aa3.88□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.88□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 PRR15Q8IV56 129 aa3.88□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 K7ERU9 68 aa3.87□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 H3BT86 120 aa3.86□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 J3QR89 54 aa3.86□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 PRO0461Q9UI25 63 aa3.86□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.85□□□□□ -1.79
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COCH-211ENST00000557065 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.85□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 hDV103S1A0JD37 113 aa3.84□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 NDUFS5O43920 106 aa3.84□□□□□ -1.79
COCH-211ENST00000557065 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.83□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 ETDBQ3ZM63 59 aa3.82□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.81□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 IGKV2-30P06310 120 aa3.81□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.81□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 K7EQZ3 153 aa3.8□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
COCH-211ENST00000557065 BPY2O14599 106 aa3.79□□□□□ -1.8
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