RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-3.38□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRIP1P50238 77 aa-3.38□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-3.38□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-3.38□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A8MTW9 85 aa-3.39□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPART-AS1P0CW21 52 aa-3.39□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFB1O75438 58 aa-3.4□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-3.4□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSC22D3Q99576 134 aa-3.4□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BUA1 57 aa-3.41□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GV90 55 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0QY20 66 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLEU1O43261 78 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITSN1Q15811 1721 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMDP11532 3685 aa-3.42□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UMAD1C9J7I0 102 aa-3.43□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFTA3P0C7M3 94 aa-3.43□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-3.43□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FANCAO15360 1455 aa-3.43□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100PP25815 95 aa-3.44□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf78Q9BR46 151 aa-3.44□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-3.45□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM107BQ9H098 131 aa-3.45□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-3.47□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACBD7Q8N6N7 88 aa-3.47□□□□□ -2.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-3.47□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-3.47□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-3.48□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEA15Q15121 130 aa-3.48□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-7P63135 1459 aa-3.48□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GUL6 1792 aa-3.48□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCNTO95613 3336 aa-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB136Q30KP8 78 aa-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNG8Q9UK08 70 aa-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC88BA6NC98 1476 aa-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED14O60244 1454 aa-3.49□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.5□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00032P0C843 101 aa-3.5□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM11AP58511 58 aa-3.5□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCER1GP30273 86 aa-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf48Q9UBA6 75 aa-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-3.51□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-3.52□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NREPQ16612 68 aa-3.52□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-3.52□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TJP1Q07157 1748 aa-3.53□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A10P60903 97 aa-3.53□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LEAP2Q969E1 77 aa-3.53□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RABAC1Q9UI14 185 aa-3.53□□□□□ -2.97
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD163L1Q9NR16 1453 aa-3.54□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-3.55□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-3.55□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRYLO94915 3013 aa-3.56□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRAPQ86VF7 1730 aa-3.57□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-3.57□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPY30Q9C005 99 aa-3.57□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPEQ02224 2701 aa-3.57□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-3.58□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf202A1L168 122 aa-3.58□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SZT2Q5T011 3432 aa-3.58□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP350Q5VT06 3117 aa-3.58□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RICTORQ6R327 1708 aa-3.58□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf88Q9BSF0 95 aa-3.59□□□□□ -2.98
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A12P80511 92 aa-3.6□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBL5Q9BZL1 73 aa-3.6□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3C2BO00750 1634 aa-3.61□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGN1P05114 100 aa-3.61□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00587B1AMM8 73 aa-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00643Q86TS7 51 aa-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HFM1A2PYH4 1435 aa-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP162Q5TB80 1403 aa-3.62□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CROCC2H7BZ55 1655 aa-3.63□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GYPAP02724 150 aa-3.65□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBP2P50120 134 aa-3.65□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF21BO75037 1637 aa-3.66□□□□□ -2.99
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-3.66□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-3.66□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-3.66□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFCAB10A6NFE3 127 aa-3.69□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RALGAPBQ86X10 1494 aa-3.69□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-3.71□□□□□ -3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPLO60437 1756 aa-3.73□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-3.73□□□□□ -3.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCMAPQ5T1S8 102 aa-3.73□□□□□ -3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.6 ms