RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITPR1Q14643 2758 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-377P-201ENST00000515965 BPTFQ12830 3046 aa-1.53□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB1P60022 68 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 NREPQ16612 68 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 TJP1Q07157 1748 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL12A1Q99715 3063 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 KDM5DQ9BY66 1539 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF1AQ12756 1690 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRBAP50851 2863 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 NHSQ6T4R5 1651 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 WT1-ASQ06250 92 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087WXM4 84 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCC1P33527 1531 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNP1P09430 55 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRIP1P50238 77 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT1XP80297 61 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST20Q9HBF5 79 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 LY75O60449 1722 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADIRFQ15847 76 aa-1.72□□□□□ -2.68
RNU6-377P-201ENST00000515965 MED14O60244 1454 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BUT2 72 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERVK-7P63135 1459 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 S100A13Q99584 98 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT1EP04732 61 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-377P-201ENST00000515965 C3P01024 1663 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BUA1 57 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 DIP2AQ14689 1571 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNG2P59768 71 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.81□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-1.82□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCA8O94911 1581 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 MROH1Q8NDA8 1641 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCER1GP30273 86 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-377P-201ENST00000515965 C18orf32Q8TCD1 76 aa-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 210 ms