RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087X002 238 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0U1RQV1 116 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 CASC2Q6XLA1 102 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFC1O43677 76 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 HSPG2P98160 4391 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GVX0 72 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 hDV103S1A0JD37 113 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 PRO0628Q9UI54 55 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 FAM229AH3BQW9 127 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 FAM236CP0DP71 79 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf26Q17RF5 130 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 Q5XG85 94 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N1X5 172 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 FAT1Q14517 4588 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 Q5VSD8 79 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 MP68P56378 58 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 RYR1P21817 5038 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 H3BPC8 53 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 H0Y9P7 68 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 LIMD2Q9BT23 127 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf195Q5TG92 126 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00208Q96KT6 92 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf87E5RJ46 101 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 OXTP01178 125 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK1P00995 79 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFS5O43920 106 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 HERC2O95714 4834 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00313P59037 77 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.64□□□□□ -1.67
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PDE4D-208ENST00000502484 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 Q5W150 140 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 MYCBP2O75592 4640 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 PRR4Q16378 134 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-208ENST00000502484 PCOTHQ58A44 107 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 TNXBP22105 4242 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 PMAIP1Q13794 54 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 H3BS24 57 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV2-30P06310 120 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-8P60410 259 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 MT1HL1P0DM35 61 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 BRK1Q8WUW1 75 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 COA5Q86WW8 74 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 HRES1P13985 223 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf92A6NGG3 77 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 A8MUU9 505 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 Q1T7F1 81 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 LCE3BQ5TA77 95 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-208ENST00000502484 DMAC1Q96GE9 116 aa4.45□□□□□ -1.7
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.44□□□□□ -1.7
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