RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.89□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.89□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 LIMD2Q9BT23 127 aa7.89□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.88□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 HERC1Q15751 4861 aa7.87□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.86□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 A8MWP4 228 aa7.86□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 PRR15Q8IV56 129 aa7.84□□□□□ -1.15
TSN-208ENST00000490104 C9orf92A6NGG3 77 aa7.83□□□□□ -1.16
TSN-208ENST00000490104 J3QL48 77 aa7.83□□□□□ -1.16
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TSN-208ENST00000490104 A0A1B0GVX0 72 aa7.81□□□□□ -1.16
TSN-208ENST00000490104 J3KT08 172 aa7.8□□□□□ -1.16
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TSN-208ENST00000490104 IMUPQ9GZP8 106 aa7.8□□□□□ -1.16
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TSN-208ENST00000490104 OXTP01178 125 aa7.78□□□□□ -1.16
TSN-208ENST00000490104 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.78□□□□□ -1.16
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TSN-208ENST00000490104 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.77□□□□□ -1.17
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TSN-208ENST00000490104 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.69□□□□□ -1.18
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TSN-208ENST00000490104 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.63□□□□□ -1.19
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TSN-208ENST00000490104 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.6□□□□□ -1.19
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TSN-208ENST00000490104 Q5W150 140 aa7.58□□□□□ -1.2
TSN-208ENST00000490104 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.57□□□□□ -1.2
TSN-208ENST00000490104 SERP2Q8N6R1 65 aa7.57□□□□□ -1.2
TSN-208ENST00000490104 C20orf197Q8N268 126 aa7.57□□□□□ -1.2
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TSN-208ENST00000490104 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.44□□□□□ -1.22
TSN-208ENST00000490104 PCOTHQ58A44 107 aa7.44□□□□□ -1.22
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TSN-208ENST00000490104 Q75L30 129 aa7.41□□□□□ -1.22
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TSN-208ENST00000490104 A0A0U1RQV1 116 aa7.41□□□□□ -1.22
TSN-208ENST00000490104 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TSN-208ENST00000490104 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.41□□□□□ -1.22
TSN-208ENST00000490104 KLKP1Q107X0 134 aa7.37□□□□□ -1.23
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TSN-208ENST00000490104 FAM236CP0DP71 79 aa7.36□□□□□ -1.23
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TSN-208ENST00000490104 SPINK7P58062 85 aa7.32□□□□□ -1.24
TSN-208ENST00000490104 H7BZZ5 65 aa7.32□□□□□ -1.24
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TSN-208ENST00000490104 COA5Q86WW8 74 aa7□□□□□ -1.29
TSN-208ENST00000490104 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.99□□□□□ -1.29
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