RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 CXCL6P80162 114 aa7.56□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 MOBPQ13875 183 aa7.56□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.55□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 J3QL48 77 aa7.55□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 NDUFC1O43677 76 aa7.55□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.54□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 BRK1Q8WUW1 75 aa7.54□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 A0A087WSZ3 146 aa7.53□□□□□ -1.2
NELFE-209ENST00000488426 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 TNXBP22105 4242 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 BPY2O14599 106 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 A0A0U1RQV1 116 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 PRR15Q8IV56 129 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 A0A087X002 238 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 CD164Q04900 197 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 PMAIP1Q13794 54 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-209ENST00000488426 MT1HL1P0DM35 61 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 SNURFQ9Y675 71 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 IGKV4-1P06312 121 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 DSCR10P59022 87 aa7.42□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 Q8N9L7 120 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-209ENST00000488426 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.4□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 Q96NJ1 140 aa7.38□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 K7EQZ3 153 aa7.38□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.38□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 A8MWP4 228 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 Q1T7F1 81 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 LIMD2Q9BT23 127 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-209ENST00000488426 NDUFB1O75438 58 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 SPINK1P00995 79 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 LRP2P98164 4655 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 HCG22E2RYF7 251 aa7.3□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP10-8P60410 259 aa7.3□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 hDV103S1A0JD37 113 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GVX0 72 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-209ENST00000488426 OCR1Q9BZK8 76 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 CASC2Q6XLA1 102 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 LPAP08519 4548 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-209ENST00000488426 C8orf87E5RJ46 101 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 RNF213Q63HN8 5207 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.15□□□□□ -1.26
NELFE-209ENST00000488426 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 LINC00313P59037 77 aa7.14□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 PSPHP1O15172 72 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 Q5VV11 94 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 NDUFS5O43920 106 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-209ENST00000488426 A8MUN3 132 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 A8MU10 97 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 A6NN06 94 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 MP68P56378 58 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 H3BPC8 53 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 H0Y9P7 68 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-209ENST00000488426 MUC2Q02817 5179 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 LINC00208Q96KT6 92 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 LCA10Q71F78 164 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 Q75L30 129 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 PRR4Q16378 134 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.97□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 C9orf92A6NGG3 77 aa6.96□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.96□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.96□□□□□ -1.29
NELFE-209ENST00000488426 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 Q5W150 140 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 A8MUU9 505 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 PRR15LQ9BU68 103 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-209ENST00000488426 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms