RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZQT0 140 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GW54 56 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 A8MUU9 505 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 IGKV4-1P06312 121 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 J3QR89 54 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 SIGMAR1Q99720 223 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 DSCR10P59022 87 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 LINC00313P59037 77 aa9.97□□□□□ -0.81
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NISCH-209ENST00000485765 ACYP1P07311 99 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 UBL5Q9BZL1 73 aa9.9□□□□□ -0.82
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NISCH-209ENST00000485765 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 J3KT08 172 aa9.87□□□□□ -0.83
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NISCH-209ENST00000485765 K7ERU9 68 aa9.86□□□□□ -0.83
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NISCH-209ENST00000485765 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.81□□□□□ -0.84
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NISCH-209ENST00000485765 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 M0R2T5 61 aa9.69□□□□□ -0.86
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NISCH-209ENST00000485765 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.58□□□□□ -0.88
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NISCH-209ENST00000485765 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.56□□□□□ -0.88
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NISCH-209ENST00000485765 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.25□□□□□ -0.93
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NISCH-209ENST00000485765 ATOX1O00244 68 aa9.2□□□□□ -0.94
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NISCH-209ENST00000485765 LINC00208Q96KT6 92 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC13Q9BS18 74 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-209ENST00000485765 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.99□□□□□ -0.97
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