RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZQT0 140 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.05□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GW54 56 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-209ENST00000485765 A8MUU9 505 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 IGKV4-1P06312 121 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 J3QR89 54 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 SIGMAR1Q99720 223 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 DSCR10P59022 87 aa9.99□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 LINC00313P59037 77 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 MT1HP80294 61 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 ACYP1P07311 99 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 UBL5Q9BZL1 73 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-209ENST00000485765 NREPQ16612 68 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 J3KT08 172 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.87□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GVX0 72 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 K7ERU9 68 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 C8orf87E5RJ46 101 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-209ENST00000485765 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-209ENST00000485765 LINC00846Q9NV44 126 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZVQ6 151 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-209ENST00000485765 BPY2O14599 106 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 NDUFB1O75438 58 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 A8MWP4 228 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-209ENST00000485765 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 M0R2T5 61 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 CXCL6P80162 114 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 LINC00643Q86TS7 51 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 PRR15Q8IV56 129 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
NISCH-209ENST00000485765 HRES1P13985 223 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-209ENST00000485765 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 K7EQZ3 153 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 SPINK7P58062 85 aa9.54□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 Q8N9L7 120 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-209ENST00000485765 hDV103S1A0JD37 113 aa9.52□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 FAM236CP0DP71 79 aa9.5□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.49□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 HCG22E2RYF7 251 aa9.48□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 CASC2Q6XLA1 102 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-209ENST00000485765 IMUPQ9GZP8 106 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-209ENST00000485765 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-209ENST00000485765 MT-ATP8P03928 68 aa9.42□□□□□ -0.9
NISCH-209ENST00000485765 NDUFS5O43920 106 aa9.4□□□□□ -0.9
NISCH-209ENST00000485765 A0A087WVE0 104 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-209ENST00000485765 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.37□□□□□ -0.91
NISCH-209ENST00000485765 Q5W150 140 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-209ENST00000485765 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.36□□□□□ -0.91
NISCH-209ENST00000485765 SCGB1A1P11684 91 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-209ENST00000485765 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-209ENST00000485765 MT2AP02795 61 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-209ENST00000485765 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2-30P06310 120 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 MT1FP04733 61 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-209ENST00000485765 ATOX1O00244 68 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 UQCRQO14949 82 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-10P60014 251 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-209ENST00000485765 MP68P56378 58 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 OCR1Q9BZK8 76 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 C4orf26Q17RF5 130 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 C5orf47Q569G3 176 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 USH2AO75445 5202 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 H0Y9P7 68 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-209ENST00000485765 LCE2BO14633 110 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-209ENST00000485765 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-209ENST00000485765 H3BPC8 53 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-209ENST00000485765 SERP2Q8N6R1 65 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-209ENST00000485765 LINC00208Q96KT6 92 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC13Q9BS18 74 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-209ENST00000485765 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 522.6 ms