RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 Q5XG85 94 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-212ENST00000485532 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 LINC00846Q9NV44 126 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.8□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 J3QR89 54 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 ACYP1P07311 99 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 C1orf195Q5TG92 126 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 Q96NJ1 140 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZVQ6 151 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 K7ERU9 68 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 NREPQ16612 68 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.75□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 UBL5Q9BZL1 73 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRAME-212ENST00000485532 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 IGKV4-1P06312 121 aa6.7□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 J3KT08 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 SIGMAR1Q99720 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 BPY2O14599 106 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 DSCR10P59022 87 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 M0R2T5 61 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 LINC00643Q86TS7 51 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 A8MWP4 228 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-212ENST00000485532 CXCL6P80162 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GVX0 72 aa6.63□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 Q8N9L7 120 aa6.63□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 K7EQZ3 153 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 PRR15Q8IV56 129 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 NDUFB1O75438 58 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.6□□□□□ -1.35
PRAME-212ENST00000485532 MT-ATP8P03928 68 aa6.58□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.57□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 C8orf87E5RJ46 101 aa6.56□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 LINC00313P59037 77 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 Q75L30 129 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WVE0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 HCG22E2RYF7 251 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 hDV103S1A0JD37 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 CASC2Q6XLA1 102 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 IMUPQ9GZP8 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRAME-212ENST00000485532 A8MUU9 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.46□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-212ENST00000485532 NDUFS5O43920 106 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 MT2AP02795 61 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 SCGB1A1P11684 91 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 Q5W150 140 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 OCR1Q9BZK8 76 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-212ENST00000485532 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 USH2AO75445 5202 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.32□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 FAM236CP0DP71 79 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 SSPOA2VEC9 5147 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 ATOX1O00244 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 UQCRQO14949 82 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 MT1FP04733 61 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 HRES1P13985 223 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 LCE2BO14633 110 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-212ENST00000485532 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 H0Y9P7 68 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-10P60014 251 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 C5orf47Q569G3 176 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 SERP2Q8N6R1 65 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-212ENST00000485532 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2-30P06310 120 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 MP68P56378 58 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 SPINK7P58062 85 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 LINC00208Q96KT6 92 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms