RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.05□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 C9orf92A6NGG3 77 aa4.05□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 H3BUT2 72 aa4.05□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 K7ERJ3 54 aa4.05□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 FABP2P12104 132 aa4.04□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.04□□□□□ -1.76
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV2-30P06310 120 aa4.02□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.02□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 Q75L30 129 aa4.02□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 A0A087WSZ3 146 aa4.01□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PNM2 257 aa4.01□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.01□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.01□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GW54 56 aa4□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 TSTD3H0UI37 97 aa4□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 Q96NJ1 140 aa4□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.99□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 CCKP06307 115 aa3.98□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 ATXN8Q156A1 80 aa3.98□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.98□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.97□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 A8MUU9 505 aa3.97□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.97□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 PDE6GP18545 87 aa3.97□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 DSCR8Q96T75 97 aa3.97□□□□□ -1.77
RBBP4-211ENST00000477563 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.96□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.96□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 C9JAW5 83 aa3.95□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 J3KT08 172 aa3.95□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.95□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.94□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.94□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 SIGMAR1Q99720 223 aa3.94□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf87E5RJ46 101 aa3.93□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV4-1P06312 121 aa3.93□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00313P59037 77 aa3.93□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 H3BT86 120 aa3.92□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 Q6ZQT0 140 aa3.92□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0A0MQY5 61 aa3.91□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.91□□□□□ -1.78
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GVX0 72 aa3.9□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GV72 72 aa3.89□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PPM0 123 aa3.89□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 MT2AP02795 61 aa3.89□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 DSCR10P59022 87 aa3.89□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 VPS25Q9BRG1 176 aa3.89□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 TAX1BP3O14907 124 aa3.88□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFB1O75438 58 aa3.88□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 BATFQ16520 125 aa3.87□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.86□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 A8MWP4 228 aa3.86□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 MT1FP04733 61 aa3.86□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.85□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.85□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.85□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.84□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.84□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.84□□□□□ -1.79
RBBP4-211ENST00000477563 NREPQ16612 68 aa3.83□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00846Q9NV44 126 aa3.83□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.82□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 PRR15Q8IV56 129 aa3.82□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.82□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.82□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.81□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.81□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.81□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 KRTAP10-10P60014 251 aa3.8□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 Q6ZVQ6 151 aa3.8□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.8□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 HRES1P13985 223 aa3.79□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.78□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 K7EP34 96 aa3.78□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 MTURNQ8N3F0 131 aa3.78□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 PRO0461Q9UI25 63 aa3.78□□□□□ -1.8
RBBP4-211ENST00000477563 BPY2O14599 106 aa3.77□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.77□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 hDV103S1A0JD37 113 aa3.76□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 K7EQZ3 153 aa3.76□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.76□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 NEBP20929 6669 aa3.75□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 SPINK7P58062 85 aa3.75□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.74□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 F8W1H4 67 aa3.74□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 FAM236CP0DP71 79 aa3.74□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.74□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 UBL5Q9BZL1 73 aa3.74□□□□□ -1.81
RBBP4-211ENST00000477563 CXCL6P80162 114 aa3.7□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 CASC2Q6XLA1 102 aa3.7□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.69□□□□□ -1.82
RBBP4-211ENST00000477563 HCG22E2RYF7 251 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms