RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf87E5RJ46 101 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DSCR10P59022 87 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00313P59037 77 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR15Q8IV56 129 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 HERC1Q15751 4861 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf92A6NGG3 77 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EQZ3 153 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CDIP1Q9H305 208 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N9L7 120 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 hDV103S1A0JD37 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 XP32Q5T750 250 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HCG22E2RYF7 251 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 CASC2Q6XLA1 102 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 Q75L30 129 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 IMUPQ9GZP8 106 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MUU9 505 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MT-ATP8P03928 68 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WVE0 104 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFS5O43920 106 aa5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 LPAP08519 4548 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 LRP2P98164 4655 aa5.03□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 PCOTHQ58A44 107 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB1A1P11684 91 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCRQO14949 82 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 Q5W150 140 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 ATOX1O00244 68 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 OCR1Q9BZK8 76 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC17Q685J3 4493 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf47Q569G3 176 aa4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y9P7 68 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 MP68P56378 58 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK7P58062 85 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2-30P06310 120 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BPC8 53 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 SERP2Q8N6R1 65 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00208Q96KT6 92 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 HRES1P13985 223 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0U1RQV1 116 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF213Q63HN8 5207 aa4.81□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 COX7CP15954 63 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC2Q02817 5179 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM236CP0DP71 79 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf197Q8N268 126 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf26Q17RF5 130 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 KLKP1Q107X0 134 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 SNURFQ9Y675 71 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4-208ENST00000462602 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE2CQ5TA81 110 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFC1O43677 76 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MUN3 132 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC179H3BU77 68 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.65□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 DMAC1Q96GE9 116 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1HP80294 61 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 H7BZZ5 65 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2T5 61 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 ACYP2P14621 99 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 S4R3F8 94 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms