RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 K7ERU9 68 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 TCL1BO95988 128 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP2P12104 132 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 Q96NJ1 140 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BMG7 143 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMB2P49721 201 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PMAIP1Q13794 54 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 BATFQ16520 125 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6Q795 121 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
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RABGEF1-206ENST00000461017 TEN1Q86WV5 123 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WSZ3 146 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 LST1O00453 97 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.72□□□□□ -1.81
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RABGEF1-206ENST00000461017 DNAL4O96015 105 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TRACP01848 142 aa3.7□□□□□ -1.82
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RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM236CP0DP71 79 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 J3KT08 172 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 DSCR10P59022 87 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 MT1HP80294 61 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf87E5RJ46 101 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BQ85 93 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R143 59 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 CCKP06307 115 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MUU9 505 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV4-1P06312 121 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 TAX1BP3O14907 124 aa3.64□□□□□ -1.83
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RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00313P59037 77 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZQT0 140 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 C9JAW5 83 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 PSPHP1O15172 72 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGEF1-206ENST00000461017 DSCR8Q96T75 97 aa3.61□□□□□ -1.83
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RABGEF1-206ENST00000461017 J3QR89 54 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGEF1-206ENST00000461017 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.56□□□□□ -1.84
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RABGEF1-206ENST00000461017 H3BT86 120 aa3.54□□□□□ -1.84
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RABGEF1-206ENST00000461017 M0R2T5 61 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR15Q8IV56 129 aa3.51□□□□□ -1.85
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RABGEF1-206ENST00000461017 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N9L7 120 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MUN3 132 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 BPY2O14599 106 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00846Q9NV44 126 aa3.46□□□□□ -1.86
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