RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TNXBP22105 4242 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR4Q96PI1 79 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087X002 238 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 BPY2O14599 106 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00483Q53H64 154 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 hDV103S1A0JD37 113 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-205ENST00000450873 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZQY7 126 aa6.23□□□□□ -1.41
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N377 158 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV4-1P06312 121 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8NBF4 154 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM29Q86T20 159 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-205ENST00000450873 PSPHP1O15172 72 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GW54 56 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFB1O75438 58 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 LIMD2Q9BT23 127 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 SPINK1P00995 79 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1-205ENST00000450873 A8MUN3 132 aa6.09□□□□□ -1.43
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N9L7 120 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.09□□□□□ -1.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
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RABGEF1-205ENST00000450873 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-205ENST00000450873 A6NN06 94 aa6.05□□□□□ -1.44
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGFL1Q6UW32 110 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q75L30 129 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01554Q52M75 96 aa5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1-205ENST00000450873 H0Y9P7 68 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf92A6NGG3 77 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00313P59037 77 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 XP32Q5T750 250 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MWP4 228 aa5.77□□□□□ -1.49
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