RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WVE0 104 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 PCP4P48539 62 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 PRR15Q8IV56 129 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 K7EQZ3 153 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 OXTP01178 125 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 HCG22E2RYF7 251 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N9L7 120 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GVX0 72 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf87E5RJ46 101 aa5.62□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 SERP2Q8N6R1 65 aa5.62□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-8P60410 259 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf195Q5TG92 126 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.6□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 UQCRQO14949 82 aa5.59□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 COX7CP15954 63 aa5.59□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 CASC2Q6XLA1 102 aa5.59□□□□□ -1.51
POLR1A-202ENST00000409024 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.58□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.58□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.58□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 hDV103S1A0JD37 113 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 OCR1Q9BZK8 76 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00313P59037 77 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf47Q569G3 176 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1A-202ENST00000409024 H3BPC8 53 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 TNXBP22105 4242 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC179H3BU77 68 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 MT1HL1P0DM35 61 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 KLKP1Q107X0 134 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFC1O43677 76 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 MP68P56378 58 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf197Q8N268 126 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0U1RQV1 116 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFS5O43920 106 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y9P7 68 aa5.42□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.39□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 A8MUU9 505 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM258P61165 79 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00208Q96KT6 92 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 SNURFQ9Y675 71 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 H7BZZ5 65 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 Q75L30 129 aa5.36□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 MUC2Q02817 5179 aa5.35□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.34□□□□□ -1.55
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf92A6NGG3 77 aa5.33□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 Q5W150 140 aa5.33□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 TPRXLQ17RH7 258 aa5.32□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.32□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 LPAP08519 4548 aa5.32□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2-30P06310 120 aa5.3□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 PRR4Q16378 134 aa5.3□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.3□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.29□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 FAM236CP0DP71 79 aa5.29□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLR1A-202ENST00000409024 XP32Q5T750 250 aa5.27□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.26□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.26□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.23□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 PCOTHQ58A44 107 aa5.22□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.22□□□□□ -1.57
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.21□□□□□ -1.58
POLR1A-202ENST00000409024 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.21□□□□□ -1.58
POLR1A-202ENST00000409024 HRES1P13985 223 aa5.19□□□□□ -1.58
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK7P58062 85 aa5.18□□□□□ -1.58
POLR1A-202ENST00000409024 A8MUN3 132 aa5.16□□□□□ -1.58
POLR1A-202ENST00000409024 ACYP2P14621 99 aa5.15□□□□□ -1.59
POLR1A-202ENST00000409024 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
POLR1A-202ENST00000409024 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
POLR1A-202ENST00000409024 DMAC1Q96GE9 116 aa5.15□□□□□ -1.59
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.09□□□□□ -1.59
POLR1A-202ENST00000409024 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1A-202ENST00000409024 COA5Q86WW8 74 aa5.08□□□□□ -1.6
POLR1A-202ENST00000409024 C4orf26Q17RF5 130 aa5.07□□□□□ -1.6
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