RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRG-201ENST00000295874 R4GN34 69 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRG-201ENST00000295874 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRG-201ENST00000295874 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRG-201ENST00000295874 SPRR1BP22528 89 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRG-201ENST00000295874 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRG-201ENST00000295874 A8MU10 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRG-201ENST00000295874 A6NN06 94 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRG-201ENST00000295874 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRG-201ENST00000295874 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRG-201ENST00000295874 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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PTPRG-201ENST00000295874 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRG-201ENST00000295874 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRG-201ENST00000295874 ANK2Q01484 3957 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRG-201ENST00000295874 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.06□□□□□ -1.44
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