RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.42□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.42□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1B0GVX0 72 aa6.41□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.4□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.4□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 EYSQ5T1H1 3165 aa6.4□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 UQCR11O14957 56 aa6.4□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8NDZ9 215 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF861PO60384 105 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 C9orf92A6NGG3 77 aa6.38□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 LRBAP50851 2863 aa6.38□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 OCR1Q9BZK8 76 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A087WTM6 91 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIVEP1P15822 2718 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.35□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8N1X5 172 aa6.34□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.33□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR4Q96PI1 79 aa6.32□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 APLNQ9ULZ1 77 aa6.31□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.3□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV7-43P04211 117 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 ITPR2Q14571 2701 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZANQ9Y493 2812 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0D9SG42 100 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CD164Q04900 197 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 APCP25054 2843 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5XG85 94 aa6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.24□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.24□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC01554Q52M75 96 aa6.23□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 OXTP01178 125 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 LCA10Q71F78 164 aa6.21□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNP2Q05952 138 aa6.21□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q1T7F1 81 aa6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRIPTQ9P021 101 aa6.19□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 HRES1P13985 223 aa6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 NF1P21359 2839 aa6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRAC1Q96KF2 57 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.16□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 USP34Q70CQ2 3546 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 TENM4Q6N022 2769 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 FBN2P35556 2912 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 WIPF1O43516 503 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR1AP35321 89 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.13□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.13□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 J3QL48 77 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5VV11 94 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPINK7P58062 85 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q75L30 129 aa6.09□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.08□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 TENM3Q9P273 2699 aa6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1B0GU33 70 aa6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.06□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5W150 140 aa6.04□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 PANO1I0J062 215 aa6.02□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR1BP22528 89 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 CSAG1Q6PB30 78 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.97□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZSA8 131 aa5.95□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A087X002 238 aa5.94□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.94□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP10-2P60368 255 aa5.92□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.92□□□□□ -1.46
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