RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.84□□□□□ -0.99
STX4-217ENST00000613541 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
STX4-217ENST00000613541 USH2AO75445 5202 aa8.84□□□□□ -0.99
STX4-217ENST00000613541 F8WEM9 126 aa8.83□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.82□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 COPS9Q8WXC6 57 aa8.82□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 SCGB1D1O95968 90 aa8.81□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.8□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.8□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 ATOH7Q8N100 152 aa8.79□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 ZNF815PA8K554 130 aa8.78□□□□□ -1
STX4-217ENST00000613541 Q6JHZ5 121 aa8.77□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 A6NDN8 102 aa8.76□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.74□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.74□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 IFITM1P13164 125 aa8.73□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.73□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.72□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 CLEC2BQ92478 149 aa8.72□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 Q96NJ1 140 aa8.72□□□□□ -1.01
STX4-217ENST00000613541 LINC00846Q9NV44 126 aa8.71□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.7□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 VAMP3Q15836 100 aa8.7□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 Q6ZVH6 145 aa8.7□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 LST1O00453 97 aa8.69□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.68□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 MT2AP02795 61 aa8.67□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.67□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.66□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 IGFL1Q6UW32 110 aa8.66□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 VAMP8Q9BV40 100 aa8.66□□□□□ -1.02
STX4-217ENST00000613541 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.64□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.63□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 A8MUU9 505 aa8.63□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 LCE2BO14633 110 aa8.63□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 FAM236CP0DP71 79 aa8.63□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 SPATA45Q537H7 98 aa8.63□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 COX8AP10176 69 aa8.62□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.62□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.62□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.62□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 hADV29S1A0JD25 119 aa8.61□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 DLEU1O43261 78 aa8.61□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 KRTAP10-10P60014 251 aa8.61□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 LINC00575Q6W349 94 aa8.61□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 Q6ZQY7 126 aa8.61□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 PYY3Q5JQD4 70 aa8.59□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.59□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.59□□□□□ -1.03
STX4-217ENST00000613541 MT1FP04733 61 aa8.58□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 C14orf144Q96I85 54 aa8.58□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.58□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.57□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 HIST1H4GQ99525 98 aa8.56□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 HIGD1BQ9P298 99 aa8.54□□□□□ -1.04
STX4-217ENST00000613541 TEN1Q86WV5 123 aa8.49□□□□□ -1.05
STX4-217ENST00000613541 H3BUT2 72 aa8.48□□□□□ -1.05
STX4-217ENST00000613541 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.47□□□□□ -1.05
STX4-217ENST00000613541 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.47□□□□□ -1.05
STX4-217ENST00000613541 SMIM6P0DI80 62 aa8.46□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.46□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 A6NJY4 79 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 DSCR10P59022 87 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 MTURNQ8N3F0 131 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 C12orf57Q99622 126 aa8.45□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 SNCGO76070 127 aa8.44□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.44□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 LINC00313P59037 77 aa8.43□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 CEND1Q8N111 149 aa8.43□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 RAB37Q96AX2 223 aa8.43□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 A0A087WSZ3 146 aa8.42□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 HRES1P13985 223 aa8.42□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 HSD52Q0P140 79 aa8.41□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.4□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.4□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 SIGMAR1Q99720 223 aa8.4□□□□□ -1.06
STX4-217ENST00000613541 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.39□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 A0A0B4J2C4 111 aa8.38□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 TSTD3H0UI37 97 aa8.36□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 GHRHP01286 108 aa8.36□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.35□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.35□□□□□ -1.07
STX4-217ENST00000613541 FXYD2P54710 66 aa8.33□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 IGKV4-1P06312 121 aa8.32□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 A8MWP4 228 aa8.31□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 H0YGX0 51 aa8.31□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 H3BMG7 143 aa8.31□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 M0R143 59 aa8.3□□□□□ -1.08
STX4-217ENST00000613541 COX6CP09669 75 aa8.27□□□□□ -1.09
STX4-217ENST00000613541 PSMB2P49721 201 aa8.26□□□□□ -1.09
STX4-217ENST00000613541 A0A1W2PNM2 257 aa8.24□□□□□ -1.09
STX4-217ENST00000613541 FABP2P12104 132 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms