RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 COX7B2Q8TF08 81 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 PRO0255Q9UI72 69 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 A0A0U1RRA0 63 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 SNURFQ9Y675 71 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 PRYO14603 147 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 GYPEP15421 78 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 NREPQ16612 68 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZVQ6 151 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WZ39 114 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 hDV103S1A0JD37 113 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 LINC00158P58513 81 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 Q8N3U1 123 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 MUC17Q685J3 4493 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 SLPIP03973 132 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 BPY2O14599 106 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.33□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 COX17Q14061 63 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 LINC00575Q6W349 94 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 OCR1Q9BZK8 76 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.32□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 NDUFS5O43920 106 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 UBE2BP63146 152 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GW54 56 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 Q8IZM0 81 aa7.27□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.26□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 UBE2L6O14933 153 aa7.26□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 REG3GQ6UW15 175 aa7.26□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZRP5 223 aa7.26□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.25□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 IGKV4-1P06312 121 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 COX7BP24311 80 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 UBE2AP49459 152 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 Q9UF83 564 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-241ENST00000602290 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.21□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.21□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 NDUFB1O75438 58 aa7.21□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.21□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 C6orf99Q4VX62 202 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 C14orf177Q52M58 125 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 LIMD2Q9BT23 127 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 VPREB1P12018 145 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.18□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.18□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 SYCNQ0VAF6 134 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 C7orf33Q8WU49 177 aa7.17□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 M0R378 163 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 IGLV6-57P01721 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 PRR4Q16378 134 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GUV1 79 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 CHTF8P0CG12 524 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 Q5VV11 94 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZQY7 126 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 Q9BRP9 147 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 DIRC1Q969H9 104 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 H3BPC8 53 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0087Q14695 138 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 A6NN06 94 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 Q75L30 129 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-241ENST00000602290 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 PSPHP1O15172 72 aa7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HCG18-241ENST00000602290 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.08□□□□□ -1.28
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