RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CFC1P0CG37 223 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 MOBPQ13875 183 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 VAMP3Q15836 100 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8NBF4 154 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 GHRHP01286 108 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 CEND1Q8N111 149 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB37Q96AX2 223 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A20O43772 301 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRR1BP22528 89 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 Q1RN00 199 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00575Q6W349 94 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-211ENST00000588374 hADV29S1A0JD25 119 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK1P00995 79 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 FXYD2P54710 66 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0B4J2C4 111 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 BATFQ16520 125 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N377 158 aa3.89□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD52Q0P140 79 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM29Q86T20 159 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JQZ4 141 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 H0YGX0 51 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZQY7 126 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SNCGO76070 127 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ERJ3 54 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMB2P49721 201 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 F8WEM9 126 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIAP1O43715 76 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-211ENST00000588374 CD164Q04900 197 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC2BQ92478 149 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 CDIP1Q9H305 208 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 LPAP08519 4548 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 COX6CP09669 75 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 LIMD2Q9BT23 127 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GX51 115 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 FABP2P12104 132 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TPRXLQ17RH7 258 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 IGFL1Q6UW32 110 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BUT2 72 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TAX1BP3O14907 124 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6JHZ5 121 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BMG7 143 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAL4O96015 105 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2V1Q13404 147 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TCL1BO95988 128 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf195Q5TG92 126 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GV72 72 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf92A6NGG3 77 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 Q5XG85 94 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP2P98164 4655 aa3.76□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.76□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf118A6NHY6 69 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BQ85 93 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 LST1O00453 97 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 TRACP01848 142 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 TEN1Q86WV5 123 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 K7EP34 96 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PNM2 257 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 ATXN8Q156A1 80 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6Q795 121 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WSZ3 146 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PPM0 123 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS25Q9BRG1 176 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-211ENST00000588374 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms