RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHTF8P0CG12 524 aa15.21■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf137Q5JT78 98 aa15.21■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBN3Q75N90 2809 aa15.2■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9orf163Q8N9P6 203 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8NBF4 154 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 REG3GQ6UW15 175 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR4Q96PI1 79 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0U1RQV1 116 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KMT2AQ03164 3969 aa15.14■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2BP63146 152 aa15.12■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.12■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM29Q86T20 159 aa15.11■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZR54 194 aa15.09■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WTM6 91 aa15.09■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TGP01266 2768 aa15.08■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DSCR10P59022 87 aa15.08■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.07■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PANO1I0J062 215 aa15.06■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH2Q9P225 4427 aa15.06■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.05■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM26A0A096LP01 95 aa15.04■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LY6G6CO95867 125 aa15.04■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRLHP81277 87 aa15.04■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa15.04■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.03■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.03■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE6AA0A183 80 aa15.02■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00476Q8WZB0 136 aa15.02■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EQZ3 153 aa15□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0G2JQZ4 141 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.98□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.97□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGFL1Q6UW32 110 aa14.97□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTL8CO15255 209 aa14.96□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.95□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.94□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM229BQ4G0N7 80 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HCG22E2RYF7 251 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2AP49459 152 aa14.86□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.85□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.84□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0Y9J4 135 aa14.83□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.83□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WSZ3 146 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR1BP22528 89 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 hDV103S1A0JD37 113 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WFDC13Q8IUB5 93 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLAC8Q9NZF1 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPLKIPQ8TAP9 179 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRO0628Q9UI54 55 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-2P60368 255 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf64Q8NEQ6 169 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00472Q9H8W2 130 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRR15Q8IV56 129 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A8MWP4 228 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MP68P56378 58 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASC2Q6XLA1 102 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV22A0A0B4J277 110 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFB1O75438 58 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRR4Q16378 134 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.55□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00208Q96KT6 92 aa14.54□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF861PO60384 105 aa14.53□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.53□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKD1P98161 4303 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRK1Q8WUW1 75 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q1T7F1 81 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0Y9P7 68 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BPC8 53 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-1P60331 282 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00483Q53H64 154 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANAPC11Q9NYG5 84 aa14.45□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV7-43P04211 117 aa14.45□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa14.42□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q96NJ1 140 aa14.42□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms