RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 C12orf57Q99622 126 aa9.48□□□□□ -0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZQY7 126 aa9.47□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-211ENST00000567434 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.46□□□□□ -0.9
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CFC1P0CG37 223 aa9.44□□□□□ -0.9
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CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0B4J2C4 111 aa9.43□□□□□ -0.9
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.29□□□□□ -0.92
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CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00313P59037 77 aa8.92□□□□□ -0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9JAW5 83 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSTD3H0UI37 97 aa8.9□□□□□ -0.98
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CCNDBP1-211ENST00000567434 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.87□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.86□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GW54 56 aa8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 J3KT08 172 aa8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0R2T5 61 aa8.84□□□□□ -0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE6GP18545 87 aa8.84□□□□□ -0.99
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