RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 CRYGAP11844 174 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 PSMB2P49721 201 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 LINC00483Q53H64 154 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 TRIAP1O43715 76 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 GAGE2AQ6NT46 116 aa8□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 LINC00575Q6W349 94 aa8□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 COX6CP09669 75 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 SLC25A20O43772 301 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 CDIP1Q9H305 208 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 H0YGX0 51 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 H3BMG7 143 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 TCL1BO95988 128 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-231ENST00000552222 hADV29S1A0JD25 119 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 SPRR1BP22528 89 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 F8W1H4 67 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 ATXN8Q156A1 80 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 PRO0461Q9UI25 63 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 LST1O00453 97 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 Q6ZQY7 126 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 Q8N377 158 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GX51 115 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 SMIM29Q86T20 159 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 CLEC2BQ92478 149 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-231ENST00000552222 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 SNCGO76070 127 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 TRACP01848 142 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 MOBPQ13875 183 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 C9JAW5 83 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 TPRXLQ17RH7 258 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 Q8NBF4 154 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 LCE2CQ5TA81 110 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 H3BT86 120 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 MTURNQ8N3F0 131 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-231ENST00000552222 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 ETDBQ3ZM63 59 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 TEN1Q86WV5 123 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 DNAL4O96015 105 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 SPINK1P00995 79 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 GHRHP01286 108 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 F8WEM9 126 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 K7ERU9 68 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-231ENST00000552222 H3BQ85 93 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 MT1HP80294 61 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 A0A0G2JQZ4 141 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 J3QR89 54 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 CD164Q04900 197 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 Q6JHZ5 121 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 IGFL1Q6UW32 110 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-231ENST00000552222 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 LIMD2Q9BT23 127 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 Q5XG85 94 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 Q6Q795 121 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GV72 72 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PNM2 257 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 VPS25Q9BRG1 176 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 ACYP1P07311 99 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 C1orf195Q5TG92 126 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.5 ms