RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 H7C2G1 150 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-222ENST00000550996 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 PYY3Q5JQD4 70 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 XP32Q5T750 250 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 Q5XG85 94 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 A0A0B4J2C4 111 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 A0A0U1RQV1 116 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 CEND1Q8N111 149 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 RAB37Q96AX2 223 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-222ENST00000550996 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 F8WEM9 126 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 FXYD2P54710 66 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 C1orf195Q5TG92 126 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 C9orf92A6NGG3 77 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 IGFL1Q6UW32 110 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-222ENST00000550996 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 Q6JHZ5 121 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 CLEC2BQ92478 149 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 A6NJY4 79 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 H0YGX0 51 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 H3BUT2 72 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-222ENST00000550996 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 TRIAP1O43715 76 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 TCL1BO95988 128 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 HSD52Q0P140 79 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 K7ERJ3 54 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 PCOTHQ58A44 107 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GX51 115 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-222ENST00000550996 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-222ENST00000550996 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-222ENST00000550996 SNCGO76070 127 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-222ENST00000550996 Q6Q795 121 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 FABP2P12104 132 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 H3BMG7 143 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 RPL37P61927 97 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 PSMB2P49721 201 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 LCE2CQ5TA81 110 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 TEN1Q86WV5 123 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-222ENST00000550996 LST1O00453 97 aa11.14□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 A0A087WSZ3 146 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PNM2 257 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 GHRHP01286 108 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 DNAL4O96015 105 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 COX6CP09669 75 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GV72 72 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 Q96NJ1 140 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-222ENST00000550996 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 H3BQ85 93 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 TRACP01848 142 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-222ENST00000550996 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 Q75L30 129 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 UBE2V1Q13404 147 aa11□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 SMIM6P0DI80 62 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 MT1HP80294 61 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-222ENST00000550996 M0R143 59 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 CCKP06307 115 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 SIGMAR1Q99720 223 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 DSCR10P59022 87 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 A8MUU9 505 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-222ENST00000550996 IGKV4-1P06312 121 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 VPS25Q9BRG1 176 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 ATXN8Q156A1 80 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-222ENST00000550996 DSCR8Q96T75 97 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-222ENST00000550996 TSTD3H0UI37 97 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-222ENST00000550996 LINC00313P59037 77 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-222ENST00000550996 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-222ENST00000550996 C9JAW5 83 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-222ENST00000550996 BATFQ16520 125 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.3 ms