RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 H0Y9J4 135 aa5.15□□□□□ -1.58
CS-215ENST00000549143 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 Q6ZVQ6 151 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 A0A087WVE0 104 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PNM2 257 aa5.14□□□□□ -1.59
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CS-215ENST00000549143 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.11□□□□□ -1.59
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CS-215ENST00000549143 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.11□□□□□ -1.59
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CS-215ENST00000549143 Q6Q795 121 aa5.08□□□□□ -1.6
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CS-215ENST00000549143 BPY2O14599 106 aa5.06□□□□□ -1.6
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CS-215ENST00000549143 RYR2Q92736 4967 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GVY2 172 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-215ENST00000549143 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-215ENST00000549143 LINC00483Q53H64 154 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-215ENST00000549143 CXCL6P80162 114 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-215ENST00000549143 A0A087X002 238 aa5.01□□□□□ -1.61
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CS-215ENST00000549143 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CS-215ENST00000549143 RYR3Q15413 4870 aa5.01□□□□□ -1.61
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CS-215ENST00000549143 FAT1Q14517 4588 aa5□□□□□ -1.61
CS-215ENST00000549143 K7EQZ3 153 aa5□□□□□ -1.61
CS-215ENST00000549143 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CS-215ENST00000549143 DSCR10P59022 87 aa4.99□□□□□ -1.61
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CS-215ENST00000549143 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.96□□□□□ -1.62
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CS-215ENST00000549143 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 SERP2Q8N6R1 65 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.92□□□□□ -1.62
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CS-215ENST00000549143 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 HCG22E2RYF7 251 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 Q96NJ1 140 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 UQCRQO14949 82 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 NDUFB1O75438 58 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 CDK2AP2O75956 126 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 PRR15Q8IV56 129 aa4.9□□□□□ -1.62
CS-215ENST00000549143 C20orf197Q8N268 126 aa4.89□□□□□ -1.63
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CS-215ENST00000549143 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 FAM229AH3BQW9 127 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 J3KT08 172 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 CASC2Q6XLA1 102 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 SNURFQ9Y675 71 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 Q5VSD8 79 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 CD164Q04900 197 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 OCR1Q9BZK8 76 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-215ENST00000549143 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.85□□□□□ -1.63
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