RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.08□□□□□ -1.6
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CLSTN3-212ENST00000541770 COX6CP09669 75 aa5.07□□□□□ -1.6
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CLSTN3-212ENST00000541770 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
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CLSTN3-212ENST00000541770 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf195Q5TG92 126 aa4.82□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 DSCR8Q96T75 97 aa4.82□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.82□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.81□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 CCKP06307 115 aa4.8□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.8□□□□□ -1.64
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A087WSZ3 146 aa4.79□□□□□ -1.64
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