RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 Q6ZQY7 126 aa10□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 TCL1BO95988 128 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 LINC01600Q96MT4 127 aa9.97□□□□□ -0.81
PACS1-208ENST00000529677 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.96□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 FABP2P12104 132 aa9.96□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 ATXN8Q156A1 80 aa9.96□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 Q8N377 158 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.95□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 A0A087X002 238 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 DNAL4O96015 105 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 SMIM29Q86T20 159 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 CRYGAP11844 174 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP10-8P60410 259 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 H3BQ85 93 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 GHRHP01286 108 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.9□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.9□□□□□ -0.82
PACS1-208ENST00000529677 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.88□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 K7EP34 96 aa9.86□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 H3BMG7 143 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 Q8NBF4 154 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-208ENST00000529677 UBE2V1Q13404 147 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 C9JAW5 83 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 MOBPQ13875 183 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 F8WEM9 126 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 H3BT86 120 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.79□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.79□□□□□ -0.84
PACS1-208ENST00000529677 Q6JHZ5 121 aa9.77□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 PRO0461Q9UI25 63 aa9.77□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.76□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.76□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.74□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 MTURNQ8N3F0 131 aa9.73□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GV90 55 aa9.72□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 IGFL1Q6UW32 110 aa9.72□□□□□ -0.85
PACS1-208ENST00000529677 CD164Q04900 197 aa9.71□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.71□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.71□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.7□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.69□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 A0A0U1RQV1 116 aa9.68□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 F8W1H4 67 aa9.68□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 A0A0G2JQZ4 141 aa9.67□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 SPINK1P00995 79 aa9.67□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 Q6Q795 121 aa9.67□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.65□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.65□□□□□ -0.86
PACS1-208ENST00000529677 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.64□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GV72 72 aa9.64□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 MUC17Q685J3 4493 aa9.64□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 DSCR8Q96T75 97 aa9.63□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PNM2 257 aa9.62□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 PDE6GP18545 87 aa9.62□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 Q5XG85 94 aa9.62□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 TEN1Q86WV5 123 aa9.62□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.61□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 Q6ZQT0 140 aa9.6□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.59□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.59□□□□□ -0.87
PACS1-208ENST00000529677 CCKP06307 115 aa9.58□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 LIMD2Q9BT23 127 aa9.58□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 ETDBQ3ZM63 59 aa9.55□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.55□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GW54 56 aa9.54□□□□□ -0.88
PACS1-208ENST00000529677 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.52□□□□□ -0.89
PACS1-208ENST00000529677 A0A087WSZ3 146 aa9.51□□□□□ -0.89
PACS1-208ENST00000529677 VPS25Q9BRG1 176 aa9.5□□□□□ -0.89
PACS1-208ENST00000529677 PRR4Q16378 134 aa9.46□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 C1orf195Q5TG92 126 aa9.46□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.45□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 Q96NJ1 140 aa9.43□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.4□□□□□ -0.9
PACS1-208ENST00000529677 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.35□□□□□ -0.91
PACS1-208ENST00000529677 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.35□□□□□ -0.91
PACS1-208ENST00000529677 LINC00846Q9NV44 126 aa9.34□□□□□ -0.91
PACS1-208ENST00000529677 NREPQ16612 68 aa9.33□□□□□ -0.92
PACS1-208ENST00000529677 ACYP1P07311 99 aa9.32□□□□□ -0.92
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