RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 C3orf84H3BNL1 204 aa11.75□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 BPY2O14599 106 aa11.75□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.75□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 ERC2-IT1O76042 136 aa11.74□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR1AP35321 89 aa11.74□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A1W2PNN7 141 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 IGKV4-1P06312 121 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH2Q9P225 4427 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPAN4-212ENST00000494815 Q6ZRX8 168 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 CHTF8P0CG12 524 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 Q8N9L7 120 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 REG3GQ6UW15 175 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 OCR1Q9BZK8 76 aa11.66□□□□□ -0.54
TSPAN4-212ENST00000494815 RTL8CO15255 209 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 PMAIP1Q13794 54 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 PRR15Q8IV56 129 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 Q9BRP9 147 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.61□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 Q8N377 158 aa11.61□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 PANO1I0J062 215 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.6□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 UBE2BP63146 152 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TSPAN4-212ENST00000494815 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.58□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A1B0GW54 56 aa11.58□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.57□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 TNP2Q05952 138 aa11.57□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.54□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.53□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A1W2PNM2 257 aa11.52□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 H0Y9J4 135 aa11.52□□□□□ -0.56
TSPAN4-212ENST00000494815 SMIM29Q86T20 159 aa11.51□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 PRLHP81277 87 aa11.51□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 C1orf137Q5JT78 98 aa11.5□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.5□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 CD164Q04900 197 aa11.49□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.49□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.49□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE6AA0A183 80 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 Q8NBF4 154 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR4Q96PI1 79 aa11.46□□□□□ -0.57
TSPAN4-212ENST00000494815 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.44□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 UBE2AP49459 152 aa11.44□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP10-2P60368 255 aa11.44□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.44□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 DSCR10P59022 87 aa11.42□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.41□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 Q1T7F1 81 aa11.41□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.4□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.4□□□□□ -0.58
TSPAN4-212ENST00000494815 hDV103S1A0JD37 113 aa11.4□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.39□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 K7EQZ3 153 aa11.38□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.36□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR1BP22528 89 aa11.35□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.35□□□□□ -0.59
TSPAN4-212ENST00000494815 Q6ZSA8 131 aa11.33□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 HCG22E2RYF7 251 aa11.33□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 PKD1P98161 4303 aa11.31□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.31□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.3□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.3□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP10-1P60331 282 aa11.3□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 PSPHP1O15172 72 aa11.28□□□□□ -0.6
TSPAN4-212ENST00000494815 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.27□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF861PO60384 105 aa11.27□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 IGFL1Q6UW32 110 aa11.26□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.26□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A0G2JQZ4 141 aa11.23□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 LINC00483Q53H64 154 aa11.22□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 A8MU10 97 aa11.21□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 NDUFB1O75438 58 aa11.21□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 IGLV7-43P04211 117 aa11.21□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.21□□□□□ -0.61
TSPAN4-212ENST00000494815 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.21□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.2□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.19□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A087WSZ3 146 aa11.18□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 MP68P56378 58 aa11.18□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 A8MUN3 132 aa11.16□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 PRR4Q16378 134 aa11.16□□□□□ -0.62
TSPAN4-212ENST00000494815 RYR2Q92736 4967 aa11.14□□□□□ -0.63
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms