RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 LY6G6CO95867 125 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 HSPG2P98160 4391 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC2Q02817 5179 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BUX3 64 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF563Q8TA94 476 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PKHD1P08F94 4074 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 IFI6P09912 130 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 EDDM3BP56851 147 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF56Q15929 161 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 Q5VV11 94 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N6K4 173 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH2Q9P225 4427 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 INE1O15225 51 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ACYP1P07311 99 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2D3P61077 147 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2D2P62837 147 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C3orf79P0CE67 100 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 COX8AP10176 69 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SMIM11AP58511 58 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FXYD4P59646 89 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMG4Q5JS54 123 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 BAGE3Q86Y29 109 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 BAGE2Q86Y30 109 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 COX7B2Q8TF08 81 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 F2Z2F3 143 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R17O96001 155 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 CCL3L1P16619 93 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TOMM5Q8N4H5 51 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 HIGD1BQ9P298 99 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 H7BZZ5 65 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FXYD3Q14802 87 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00643Q86TS7 51 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 M0R2N4 97 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01600Q96MT4 127 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SNURFQ9Y675 71 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 HMGN4O00479 90 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 FXYD1O00168 92 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 COX6CP09669 75 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SPAG11BQ08648 103 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00208Q96KT6 92 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 J3QRE1 110 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 BCE1O60756 84 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 GNG13Q9P2W3 67 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 PKD1P98161 4303 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV4-1P06312 121 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 GCHFRP30047 84 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB136Q30KP8 78 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 KAAG1Q9UBP8 84 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM14DPA8MWL7 114 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 M0R1W7 72 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 MYCBP2O75592 4640 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BSH0 61 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 PRH1P02810 166 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 V9GYV3 84 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GWA3 101 aa2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms